بررسی الگوی ژنتیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس جدا شده از بیماران مبتلا به سل ایرانی و افغانی: با استفاده از روش تایپینگ VNTR

هدف از این مقاله متمایزکردن الگوی ژنتیکی سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ایرانی و افغانی مسلول با استفاده از هفت لوکوس ژنی با روش تایپینگ VNTR می باشد.
191 سویه جدا شده از بیماران سل ریوی از نظر الگوی VNTR مورد بررسی قرار گرفتند. (بین سالهای 87-85) و با استفاده از پروتوکل استاندارد آنالیز شدند. در نهایت تنوع اللی هر یک از پرایمرها در دو سویه ایرانی و افغانی محاسبه گردید.
مقایسه تنوع اللی بین سویه های افغانی و ایرانی نشان می دهد که الگویVNTR در سویه های افغانی نسبت به سویه های ایرانی کمتر می باشد. البته بجز لوکوس ETR-E که دارای تنوع بیشتری می باشد. بر اساس شاخص افتراق کل سویه ها، لوکوس ETR-A بعنوان لوکوس بسیار افتراق دهنده (HGI≥0.6) و لوکوس های MPTR-A، ETR-C، ETR-B ETR-F، ETR-E، بعنوان لوکوس های افتراق دهنده متوسط (HGI≥0.4-0.6) و لوکوسETR-D بعنوان ضعیف ترین لوکوس افتراق دهنده شناسایی شدند. مقاومت آنتی بیوتیکی و بیماران با سابقه در سویه های افغانی بیشتر از سویه های ایرانی بود (000/0=p).
روش VNTR، سریع، آسان و بسیار پایدار است و برای مطالعات اپیدمیولوژی قابل استفاده است.