مطالعه مولکولی، تکاملی و طبقه بندی ژن های خانواده پروتئین های 70 کیلودالتونی شوک گرمایی (Hsp70) در گاو

پروتئین های شوک گرمایی (Hsp) به علت ارتباط با صفات مهم اقتصادی در دام ها از قبیل مقاومت به تنش گرمایی و ورم پستان دارای اهمیت هستند. در تحقیق حاضر برای آگاهی از روند تکاملی و بررسی ساختار مولکولی ژن های خانواده پروتئین های 70 کیلودالتونی (Hsp70)، توالی ژنومی آنها در گاو و موجودات دیگر از بانک اطلاعاتی NCBI به دست آمده و مرتب شدند. سپس محاسبه درصد جایگزینی نوکلئوتیدها با یکدیگر، با استفاده از روش حداکثر درست نمایی و ترسیم درخت فیلوژنی و تکامل مولکولی به روش neighbor-joining انجام شد. نتایج مطالعات بیوانفورماتیک نشان داد که ژن های این خانواده دارای پراکندگی متعدد کروموزومی هستند، که به وجود آورنده نسخه های زیادی جهت تظاهر ژنی مورد نیاز برای بروز صفات مرتبط می باشند. از طرفی درصد جایگزینی بازهای پیریمیدینی در این خانواده ژنی بسیار بیشتر از میزان جایگزینی بازهای پورینی به پریمیدین و یا پورین می باشد. نسبت های dN/dS بیان کننده انتخاب خالص و تثبیت آنها در طی تکامل ژن های این خانواده می باشد. نتایج فیلوژنی نشان می دهد که پروتئین های خانواده Hsp70 با توجه به مسیر تکاملی خود عمدتا به دو دسته مجزا تقسیم می شوند. در دسته اول پروتئین هایb و Hsp70 12a و در دسته دوم دیگر توالی های پروتئینی Hsp70 در شاخه های متعددی قرار گرفته اند.