مکان یابی QTLهای خصوصیات جوانه زنی در برنج با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره تحت شرایط شور

قدرت جوانه زنی بالا و قوی تر بودن اجزای یک جوانه در برنج از مهمترین صفات در استقرار بهتر گیاهچه در سیستمهای کشت مستقیم و محیطهای شور و خشک می باشد. به منظور مکان یابی صفات مرتبط با جوانه زنی در برنج از جمعیت F2:3 حاصل از تلاقی ارقام طارم محلی با خزر و 74 نشانگر ریزماهواره استفاده شد. نقشه ژنتیکی 50/1231 سانتی مورگان از ژنوم برنج را پوشش داد. مکانهای ژنی مرتبط با سرعت جوانه زنی، طول ریشه چه و طول ساقه چه با روش های نقشه یابی فاصله ای ساده و مرکب ردیابی گردید. از بین QTLهای ردیابی شده برای سرعت جوانه زنی qGR-10 روی کروموزوم 10 با 97/60 درصد تغییرات فنوتیپی، بالاترین درصد توجیه تغییرات را داشت. اثر افزایشی این ناحیه از ژنوم برنج روی کروموزوم 7، مثبت و در جهت افزایش سرعت جوانه زنی بود. بین QTLهای مرتبط با طول ریشه چه qRL-8 با تبیین 21/40 درصد بالاترین درصد تغییرات فنوتیپی کل را داشت. آلل های والد طارم در qRL-1 و qRL-10 طول ریشه چه ها را به ترتیب به اندازه 31/0 و 88/0 میلی متر افزایش دادند. کلیه QTLهای بزرگ اثر مکان یابی شده برای طول ساقه چه در این مطالعه روی کروموزوم یک قرار داشتند. بالا بودن درصد توجیه qGR-7، qRL-10 و qSL-1 آنها را کاندید بسیار مناسبی برای برنامه های انتخاب به کمک نشانگر در جمعیتهای برنج ایرانی ساخت.