«در کشاکش دین و دولت» عنوان تازه ترین اثر محمدعلی موحد است. کتاب حاضر حاصل پژوهش های موحد درباره رابطه میان دین و دولت در اسلام و ارتباط ایران و ایرانیان با این مسئله است. او در کتاب حاضر دوران 30ساله پس از رحلت پیامبر اسلام در سال 11 هجری را تا صلح امام دوم شیعیان با معاویه در سال 41 هجری روایت می کند و به گفته خودش می کوشد «با دقت در مضمون روایت های مورخان و تعمق در زیر و بم آن ها، تصویری بالنسبه معقول و قابل اعتماد از آن دوران به دست دهد». بر این اساس، موحد از دو منظر می کوشد به این دوران 30ساله بپردازد: 1) از منظری که عمده تمرکزش بر مقوله شکل گیری و تاسیس حکومت اسلامی و مقوله خلافت است،