به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت
فهرست مطالب نویسنده:

a. sharifi

  • Comparison of the Antibacterial Activity of Hydroalcoholic Extracts of cydonia oblonga and Hypericum perforatum with Clindamycin against standard strain and clinical isolates of Biofilm Formation of Staphylococcus Aureus
    N. Gholami, A. Sharifi*, A. Khosravani, M. Zoladl, S.S. Khoramrooz, K. Sharifi

    Background and subject :

    The ability of Staphylococcus aureus for biofilm formation caused increase bacterial viability in the host environment and antibiotic resistance. The aim of this study was to comparison of the antibacterial activity of hydroalcoholic extracts of Cydonia oblonga,Hypericum perforatum with Clindamycin and synergistic effect of them against standard strain and clinical isolates  of Biofilm formation with simultaneous genes presentation of Staphylococcus Aureus.

    Materials and Methods

    In this descriptive and analytical study, 148 clinical strains were collected. Phenotypic analysis was performed by concord plate agar method and genotypic checking by PCR genes was performed simultaneously. MIC, were obtained by microbroth dilution method. Data were analyzed by SPSS software version 21 and descriptive.

    Results

    MIC of cydonia oblonga extract, Hypericum perforatum extract; Simultaneous use of them on different concentration and Concomitant use of them and clindamycin antibiotics in standard strains of Staphylococcus aureus were 3125,375,1500,12500 and 2.5 respectively. MBC of cydonia oblonga extract, Hypericum perforatum extract; Simultaneous use of them on different concentration and Concomitant use of them and clindamycin antibiotics in standard strains of Staphylococcus aureus were 6250, 1500,1500,12500 and 10 respectively.

    Conclusion

     MIC and MBC of cydonia oblonga extract more precious than Hypericum perforatum extract and simultaneous of them and zone of inhibition diameter of Hypericum perforatum and hydroalcoholic extract of Cydonia oblonga extract and the antibiotic clindamycin was higher than this index in the case of hydroalcoholic extract.

    Keywords: Staphylococcus Aureus, Biofilm Gene, Cydonia Oblonga, Hypericum Perforatum
  • F. Rrashidpour, F. Mazloomirad, S.S. Khoramrooz, A. Sharifi, M.A. Ghatee, S.R. Khosravani, A. Mansourian, S.A. Khosravani*
    Aims

    Klebsiella pneumoniae is a common cause of urinary tract infections (UTIs), especially in hospitals. Quinolones work by blocking bacterial DNA gyrase and topoisomerase IV, but the presence of qnr genes enables bacteria to survive despite these drugs. This study aimed to evaluate antibiotic susceptibility and the prevalence of plasmid-mediated quinolone resistance genes (qnrA, qnrB, qnrS) in these isolates.

    Instruments & Methods

    In this descriptive, cross-sectional study, 142 K. pneumoniae isolates were collected from UTI patients at Imam Sajjad and Kosar hospitals in Yasuj and Shiraz, Iran, during 2020-2021. The disk diffusion method assessed resistance to various antibiotics, with a focus on quinolones. Multiplex PCR was used to detect qnrA, qnrB, and qnrS genes in quinolone-resistant isolates.

    Findings

    Ciprofloxacin showed the highest resistance rate (60.6%). Sensitivity was comparatively higher for sulfamethoxazole-trimethoprim (39.4%) and nalidixic acid (39.7%). The qnrA, qnrB, and qnrS genes were found in 31.4%, 55.8%, and 10.5% of isolates, respectively. Coexistence of qnrA and qnrB occurred in 11 isolates, while qnrB and qnrS coexisted in 5 isolates. One isolate exhibited all three genes.

    Conclusion

    The study reveals a substantial prevalence of plasmid-mediated quinolone resistance genes in K. pneumoniae isolates from UTIs in these hospitals.

    Keywords: Klebsiella Pneumoniae, Antibiotic, Drug Resistance, Quinolones, Genes
  • شیلان فعله گری، کامران مروج*، علیرضا شریفی، احمد گلچین، پرویز کرمی
    پیشینه و اهداف

    هر کشوری به خاک به عنوان یک منبع طبیعی حیاتی، متکی است که به طور قابل توجهی در حفظ محیط زیست و تولید مواد غذایی کمک می کند. تهیه نقشه توزیع عناصر غذایی خاک به عنوان یک ابزار ارزشمند برای تصمیم گیری مدیران عمل می کند. با توجه به ماهیت زمان بر و پرهزینه آنالیز آزمایشگاهی برای این متغیرها در مقیاس بزرگ، تلاش هایی برای کاوش نیتروژن خاک از طریق سنجش از دور انجام شده است. پژوهش حاضر، به کاربرد روش های سنجش از دور همراه با مدل های رگرسیون و تصادفی جنگل برای پیش بینی نیتروژن کل خاک در استان گیلان می پردازد. این مطالعه، با هدف پاسخ به دو سوال اصلی انجام شد: (1) آیا می توان از داده های SAR برای تعیین مقدار نیتروژن کل خاک استفاده کرد؟ (ب) الگوریتم های ماشین بردار پشتیبانی (SVM)، درخت رگرسیون تقویت شده (BRT) و جنگل تصادفی (RF) در پیش بینی محتوای نیتروژن خاک چگونه عمل می کنند؟

    روش ها

    این مطالعه بر ارزیابی قابلیت های داده ای ماهواره های Landsat-9 و Sentinel-1 به صورت جداگانه و ترکیبی، با استفاده از الگوریتم های پیشرفته مانند SVM، RF و BRT متمرکز شد.. نمونه برداری هدفمند به صورت استراتژیک انجام شد تا شرایط متنوع منطقه مورد مطالعه را بر اساس پوشش زمین/ کاربری زمین، پارامترهای اقلیمی و توپوگرافیکی نشان دهد. متغیرهای مختلف، از جمله پارامترهای آب وهوایی، اجزای توپوگرافی، و شاخص های زیرگروه سنجش از دور، در ارتباط با داده های SAR و تصاویر نوری مورد بررسی قرار گرفتند. الگوریتم های یادگیری ماشین غیرخطی، به ویژه SVM، RF و BRT برای پیش بینی وضعیت نیتروژن کل خاک با مدل سازی روابط پیچیده بین خواص خاک و متغیرهای محیطی مورد استفاده قرار گرفتند. نرم افزار R، با استفاده از بسته CARET برای ورودی پارامتر، برای پیاده سازی الگوریتم استفاده شد.

    یافته ها

    نتایج، حاکی از موارد زیر بود: عملکرد الگوریتم های RF و BRT از SVM پیشی گرفت و در پایش مقادیر نیتروژن کل خاک موثر بود، تصاویر SAR چند زمانی دقت بالاتری را در نظارت بر محتوای نیتروژن کل خاک در مقایسه با داده های سنجش از دور نوری نشان دادند و پیش بینی های واقعی تر را در خاک های شالیزاری تسهیل کردند، ادغام متغیرهای محیطی منجر به افزایش دقت الگوریتم ها شد. متغیرهای سنجش از دور، نقش مهمی را در این پژوهش ایفا کردند و به ترتیب، تاثیر 61 و 51 درصدی در الگوریتم های RF و BRT گزارش شد. مقایسه الگوریتم های SVM و RF نشان داد که RF پس از اجرای الگوریتم BRT در رتبه دوم قرار دارد و دقت برآورد نیتروژن کل خاک با الگوریتم SVM به دست نیامد. با این حال، الگوریتم های BRT و RF قادر به نظارت بر تغییرات نیتروژن کل خاک بودند و BRT با ثبت دقیق 58٪ تغییرات به دلیل مقدار R2 بالاتر (58/0) و مقادیر RMSE (25/0 میلی گرم بر کیلوگرم) و  MAE (19/0 میلی گرم بر کیلوگرم) کمتر، عملکرد بهتری داشت.

    نتیجه گیری

    در انتها، موارد کلیدی زیر به عنوان نتیجه گیری کلی از این پژوهش استخراج شد: 1) الگوریتم های RF و BRT در نظارت بر سطوح نیتروژن کل خاک به طور موثر بهتر از SVM عمل کردند، 2) تصاویر SAR چند زمانی دقت بالایی در ردیابی نیتروژن کل خاک در مقایسه با سنجش از دور نوری ارائه می دهند و پیش بینی دقیق را در خاک های شالیزاری تسهیل می کنند، 3) ترکیب متغیرهای محیطی باعث افزایش دقت الگوریتمی شد و 4) متغیرهای سنجش از دور به ترتیب 61 و 51 درصد به الگوریتم های RF و BRT کمک کردند.

    کلید واژگان: درختان رگرسیون تقویت شده، لندست-9، جنگل تصادفی، سنتینل-1، ماشین بردار پشتیبانی، نیتروژن کل خاک
    Sh. Felegari, K. Moravej *, A. Sharifi, A. Golchin, P. Karami
    Background and Objectives

    Every country relies on soil as a vital natural resource that significantly contributes to environmental conservation and food production. Preparation of soil nutrient distribution map serves as a valuable tool for managers to make decisions. Due to the time-consuming and expensive nature of laboratory analysis for these variables on a large scale, efforts have been made to explore soil nitrogen through remote sensing. The current research deals with the application of remote sensing methods along with regression and random forest models to predict total soil nitrogen in Gilan province. This study aimed to answer two main questions: (1) Can SAR data be used to quantify total soil nitrogen (TSN) (2) How do SVM, BRT and RF algorithms perform in predicting soil nitrogen content?

    Methods

    This study focused on evaluating the data capabilities of Landsat-9 and Sentinel-1 satellites individually and in combination, using advanced algorithms such as Support Vector Machine (SVM), Boosted Regression Tree (BRT), and Random Forest (RF). The purpose of this evaluation was strategic, aiming to showcase the diverse conditions of the study area based on land cover/land use, climatic, and topographical parameters. Various variables, including climate parameters, topographic components, and remote sensing subscale indices, were investigated in conjunction with SAR data and optical images. Nonlinear machine learning algorithms, specifically SVM, RF, and BRT, were employed to predict total soil nitrogen status by modeling complex relationships between soil properties and environmental variables. R software, utilizing the CARET package for parameter input, was employed to implement the algorithm.

    Findings

    The results indicated the following: RF and BRT algorithms outperformed SVM and were effective in monitoring total soil nitrogen values. Multi-temporal SAR images showed higher accuracy in monitoring total soil nitrogen content compared to optical remote sensing data, facilitating more realistic predictions in paddy soils. The integration of environmental variables led to an increase in the accuracy of algorithms, where remote sensing variables played a crucial role, contributing to 61% and 51% effects in RF and BRT algorithms, respectively. The comparison of SVM and RF algorithms revealed that RF ranked second after the BRT algorithm, and the accuracy of total soil nitrogen estimation was not achieved with the SVM algorithm. However, both BRT and RF algorithms were able to monitor changes in total soil nitrogen. BRT performed better, accurately recording 58% of changes, as evidenced by a higher R2 value (0.58) and lower RMSE (0.25 mg/kg) and MAE (0.19 mg/kg) values.

    Conclusion

    In conclusion, the following key points were extracted from this research: 1) RF and BRT algorithms outperformed SVM in effectively monitoring total soil nitrogen levels; 2) multi-temporal SAR images demonstrated higher accuracy in tracking total soil nitrogen compared to optical remote sensing, enabling precise predictions in paddy soils; 3) the incorporation of environmental variables enhanced algorithmic accuracy; and 4) remote sensing variables contributed 61% and 51% to RF and BRT algorithms, respectively.

    Keywords: Boosted Regression Trees Landsat-9, Random Forest, Sentinel-1, Support Vector Machine, Total Soil Nitrogen
  • سمیرا وره زردی، ایوب عزیزی*، علی کیانی، امیر فدایی فر، افروز شریفی
    هدف از انجام پژوهش حاضر، بررسی اثر نوع منبع نیتروژن غیر پروتیینی (NPN) در جیره حاوی پروتیین زیاد و تعداد نوبت خوراک دهی بر عملکرد رشد، تخمیر و فعالیت آنزیم های میکروبی شکمبه بود. از 28 راس بره نر پرواری لری-بختیاری با دامنه سنی چهار تا پنج ماهه و میانگین وزن زنده 3±1/36 کیلوگرم در قالب آزمایش فاکتوریل 2×2 بر پایه طرح کاملا تصادفی با چهار تیمار آزمایشی و هفت تکرار استفاده شد. جیره های آزمایشی حاوی اوره یا بیورت (اوره حرارت داده شده) بودند که هرکدام به تعداد دو یا سه وعده در روز تغذیه شدند. نتایج نشان داد که هیچ یک از صفات تحت تاثیر آثار متقابل نوع منبع NPN و تعداد نوبت خوراک دهی قرار نگرفتند (05/0<P). بره های مصرف کننده بیورت در مقایسه با اوره، میانگین افزایش وزن روزانه بیشتر و ضریب تبدیل خوراک مطلوب تری داشتند (05/0>P). غلظت نیتروژن آمونیاکی مایع شکمبه در سه و شش ساعت پس از خوراک دهی و فعالیت آنزیم های پروتیازی شکمبه در همه زمان های مورد بررسی برای جیره های حاوی بیورت نسبت به اوره کاهش یافت (05/0>P). در زمان سه ساعت پس از خوراک دهی، تغذیه با بیورت در مقایسه با اوره و نیز دفعات خوراک دهی سه بار در مقایسه با دو بار در روز سبب افزایش غلظت استات، کل اسیدهای چرب فرار و فعالیت کربوکسی متیل سلولاز شکمبه شد (05/0>P). در کل، استفاده از بیورت به عنوان یک منبع اوره آهسته رهش در جیره حاوی پروتیین زیاد، نسبت به اوره و با تغذیه سه بار در روز سبب بهبود عملکرد رشد و فراسنجه های تخمیر شکمبه بره های پرواری شد.
    کلید واژگان: بره پرواری، تعداد وعده خوراک دهی، فراسنجه های شکمبه، فعالیت آنزیمی، نیتروژن غیر پروتئینی
    S. Varezardi, A. Azizi *, A. Kiani, A. Fadayifar, A. Sharifi
    Introduction
    The lack of animal feed resources and the increase in animal feed costs relative to the total production costs have created challenges in supplying society with animal protein. Therefore, correctly estimating the nutritional value of feed, especially protein sources, can be an important step in meeting the needs of livestock and reducing production costs. Protein is the most important and expensive nutrient used in ruminant diets. Using non-protein nitrogen (NPN) sources such as urea or its products can be considered a cheap alternative source in animal feeding. Iran is one of the most important urea-producing countries in the world; therefore, using urea or its slow-release products as a feed additive in animal nutrition can be beneficial. In the past years, various sources of slow-release urea have been produced and used in animal feeding. Biuret (heated urea) is one of the slow-release urea compounds, and its production cost is lower than other slow-release urea sources. Compared to urea, it has less solubility in water and is converted to ammonia in the rumen at a much slower rate. It is also less toxic than urea and has a lower negative effect on feed palatability, so it can be used to a greater extent than urea in the diet of ruminants. Biuret is very safe and it can be included in the diet of animals in an amount of 20 times higher than the toxic dose of urea. Biuret usually contains 248.5% crude protein (39.8% nitrogen content), which is a little less than urea. On the other hand, increasing the daily feeding frequency is one of the management methods that may improve the productive performance of livestock, as well as the quantity and quality of the carcass. Increasing the feed frequency may improve nitrogen retention and reduce body fat. It is believed that increasing the frequency of daily feeding will keep the feed fresh, reduce the amount of feed waste, and improve livestock performance. Therefore, this study aimed to investigate the effect of NPN source, in high-protein diets, and feeding frequency on growth performance, rumen parameters, and the activity of rumen microbial enzymes of fattening lambs.
    Materials and methods
    Twenty-eight male Lori-Bakhtiari fattening lambs (age: four to five months; live weight: 36.1±3 kg) were assessed for 60 days using a 2×2 factorial experiment in a completely randomized design with four treatments and seven replications. The experimental high-protein diets (16% of DM) contained urea or biuret, which were given to the lambs in the form of a total mixed ration two or three times a day. The lambs were kept in 1×1.5 m2 individual stalls. Nutrient intake, growth performance, and ruminal parameters [on day 45 of the experiment at fasting (before morning feeding), three, and six h after feeding] including pH, ammonia and volatile fatty acid concentrations, and microbial enzyme activity were measured.
    Results and discussion
    Results showed that intakes of dry matter, organic matter, crude protein, neutral detergent fiber and ether extract, final weight, and total weight gain were not affected by NPN type or feeding frequency (P<0.05). Compared to urea, lambs consuming biuret had higher average daily gain and better feed conversion ratio (P<0.05). The ruminal pH was not affected by the NPN source, feeding frequency, and their interaction (P<0.05). Rumen ammonia nitrogen concentration at three and six hours after morning feeding was significantly higher in lambs fed the diet containing urea than in biuret (P<0.05). The effect of NPN source, feeding frequency, and their interaction was not significant at 0 and six h after feeding on the ruminal concentration of total volatile fatty acids (VFA), acetate, propionate, butyrate, valerate, iso-valerate, and acetate to propionate ratio (P<0.05). However, feeding a diet containing biuret and given three times a day increased total VFA and acetate concentration at three hours post-feeding (P<0.05). The ruminal activity of carboxymethyl cellulase at 0, three, and six hours after feeding increased in animals fed biuret-containing diet compared to urea (P<0.05). However, rumen protease activity significantly increased in lambs fed a urea-containing diet than biuret-containing diet (P<0.05). Feeding three times a day increased the activity of carboxymethyl cellulase at three hours post-feeding (P<0.05). Filter paper degrading activity at three and six hours after feeding in lambs fed biuret was significantly higher than those fed urea (P<0.05). The activity of microcrystalline cellulase and α-amylase was not affected by the NPN source, feeding frequency, and their interaction (P<0.05).
    Conclusions
    Using biuret compared to the urea, in high-protein diets, and feeding diets three times a day, compared to two times a day, improved rumen fermentation parameters and performance of fattening lambs.
    Keywords: Fattening lamb, Feeding frequency, Rumen fermentation parameters, Enzyme activity, Non-protein nitrogen
  • F. Nematishahri, O. Pouresmaeil, A. Sharifi, F. Mardani, J. Mardaneh*
    Aims

    Female genital tuberculosis is an infrequent form of tuberculosis that is often underestimated due to its low prevalence in developed countries, difficult and delayed diagnosis, and misleading clinical presentation. This systematic review aimed to describe the epidemiology, clinical presentation, diagnosis, and treatment of female genital tuberculosis during 2000-2021.

    Information & Methods

    The current study is a systematic review that was conducted through exploration of English keywords like “female genital tuberculosis”, “vulva tuberculosis”, “tuberculosis”, and “genital system” as well as, Persian keywords. Furthermore, a similar search methodology was employed in various international databases, including PubMed, Scopus, and Web of Sciences, as well as in certain Iranian databases, like Irandoc and Magiran, between 2000 and 2021.

    Findings

    Most patients (37.5%) were from India. Upper genital tuberculosis was more common among women of reproductive age, and the most involved upper genital organs were the endometrium and fallopian tubes. In contrast, vulvar tuberculosis was more prevalent in postmenopausal women, and the vulva was the most common site involved in lower genital tuberculosis. Weight loss (31.25%) and vaginal discharge (31.25%) were the most common symptoms reported by the study participants. The main histologic finding in female genital TB was the presence of epithelioid cell granulomas (81.25%). 29 (90.6%) patients received the standard antibiotic therapy (combination of rifampicin, isoniazid, ethambutol, and pyrazinamide), all of whom responded positively.

    Conclusion

    Most patients experience prolonged vulva ulcers and inadvertently receive various antibiotics. The typical lesions are epithelioid cell granulomas, which may be accompanied by Langerhans giant cells.

    Keywords: Tuberculosis, Female Fertility, Genital Infection
  • محسن عزیزی، نیما بهادر، اصغر شریفی
    زمینه و هدف

     در این مطالعه، به عنوان یک زمینه پژوهشی، بررسی کاربرد نانوذرات و گیاهان دارویی در درمان بیماری های ناشی از پسودموناس آییروژینوزا مورد بررسی قرار گرفت. هدف از این مطالعه تعیین و تاثیر نانوذره روی (Zn) آغشته شده به اسانس مرزه خوزستانی Satureja khuzestanica بر میزان بیان ژن lasR در جدایه های بالینی پسودوموناس آیروژینوزا تشکیل دهنده بیوفیلم در شرایط برون تنی بود.

    روش بررسی

     این یک مطالعه تجربی می باشد که در سال 1399 بر روی 150 نمونه بالینی مشکوک به پسودموناس آیروژینوزا غیر تکراری و متناوب که از نمونه های پوست، خون و ادرار بیماران بستری در بخش های مختلف بیمارستان امام سجاد (ع) شهر یاسوج جمع آوری شد، انجام گرفت. پس از ورود 4 سویه بالینی به همراه یک سویه استاندارد پسودوموناس آیروژینوزا   (ATCC 25922) به عنوان نمونه، اسانس مرزه خوزستانی از شرکت دارویی باریج اسانس (کاشان، ایران) تهیه شد. سپس، پس از تعیین هویت نمونه  پسودوموناس آیروژینوزا جدا شده از بیماران،  PCRجهت تایید حضور ژنlasR  و ژن DNA gyrase A ، تعیین الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی، آزمون میکرودایلوشن براث، رقیق سازی چکربورد، آزمون آگار برای تعیین حداقل غلظت کشندگی، بررسی بیان ژن lasR  با Real time PCR، در شرایط آزمایشگاهی مورد ارزیابی قرار گرفتند. داده های جمع آوری شده بر استفاه از آزمون های آماری من ویتنی، تی و تی جفت نمونه ای تجزیه و تحلیل شدند.

    یافته ها

     با توجه به نتایج الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی، بیشترین مقاومت مربوط به آمیکاسین (30 میکروگرم)، کولیسین (10 میکروگرم) و سیپروفلوکسازین (5 میکروگرم) بود و کمترین مقاومت مربوط به سفتازیدین (30 میکروگرم)، و ایمی پنم (10 میکروگرم)، بود. هم چنین، اسانس مرزه خوزستانی و نانوذرات اکسید روی در برابر سویه استاندارد و جدایه های بالینی، دارای حداقل غلظت مهاری (256512 میکروگرم/میلی لیتر) بودند. حد شاخص غلظت مهاری نسبی (FIC) برابر عدد 1 شد که نماینگر اثر افزایش است. هم چنین، حداقل غلظت باکتری کشی (MBC) چهار برابر حداقل غلظت مهاری (MIC) بود. بالاترین MIC، مربوط به نانوذرات اکسید روی و کمترین آن مربوط به استفاده هم زمان اسانس و نانوذره شد. در حالت ترکیبی تیمارها، به نصف غلظت MIC تیمارهای مجزا، نیاز بود. هم چنین، با کاهش اثر مهار کنندگی تیمارهای مورد مطالعه، تولید بیوفیلم افزایش یافت. میزان بیان ژن lasR در غلظت MIC انواع تیمارهای مطالعه متفاوت بود؛ کم ترین میزان بیان ژن lasR در غلظت MIC به هر یک از تیمارها به تنهایی و بیشترین به استفاده همزمان تیمارها اختصاص داشت.

    نتیجه گیری

     نتایج نشان داد که سویه های بالینی به برخی از آنتی بیوتیک ها بسیار مقاوم بودند، اما به برخی دیگر حساس بودند. هم چنین، ترکیبات اسانس گیاه مرزه خوزستانی شناسایی و تجزیه شدند. اصلی ترین ترکیب این اسانس کارواکرول بود که خاصیت ضدعفونی کننده دارد. با استفاده از FT-IR، گروه های عاملی پلیمر قالب مولکولی و اسانس شناسایی شدند. نتایج نشان داد که ترکیب اسانس و نانوپلیمر روی به صورت جداگانه منجر به کاهش بیان ژن lasR در سویه های بالینی می شوند. با ترکیب این دو تیمار، تاثیر کاهش بیان ژن lasR قوی تر و اثربخش تر می شود.

    کلید واژگان: پسودوموناس آئروژینوزا، نانوذره روی، اسانس مرزه خوزستانی، lasR، بیوفیلم
    M. Azizi, N. Bahadur, A. Sharifi
    Background & aim

    In the present study, as a research background, the application of nanoparticles and herbal medicines in the treatment of diseases caused by Pseudomonas aeruginosa was investigated. The aim of this study was to determine the effect of zinc nanoparticles (Zn) impregnated with Khuzestan savory (Satureja khuzestanica) essential oil on the expression of lasR gene in clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa, which are biofilm-forming bacteria, under extracellular conditions.

    Methods

    The present experimental study was conducted in 2019 on 150 non-repetitive and intermittent clinical samples suspected of Pseudomonas aeruginosa, which were collected from skin, blood, and urine samples of hospitalized patients in various wards of Imam Sajjad (AS) Hospital in Yasuj city. After the entry of 4 clinical strains along with a standard strain of Pseudomonas aeruginosa (ATCC 25922) as a sample, Khuzestan savory essential oil was prepared from Barij Essence Pharmaceutical Company (Kashan, Iran). Then, after identifying the Pseudomonas aeruginosa sample separated from the patients, PCR was performed to confirm the presence of lasR and DNA gyrase A genes, determine the antibiotic sensitivity pattern, broth microdilution test, checkerboard dilution, and agar test to determine the minimum inhibitory concentration, and real-time PCR to investigate the expression of lasR gene under laboratory conditions. The collected data were analyzed using Mann-Whitney U, T-Test, and Paired T-Test statistical tests.

    Results

    According to the results of the antibiotic sensitivity pattern, the highest resistance was related to amikacin (30 μg), colistin (10 μg), and ciprofloxacin (5 μg), and the lowest resistance was related to ceftazidime (30 μg) and imipenem (10 μg). Also, Khuzestan savory essential oil and zinc oxide nanoparticles had a minimum inhibitory concentration of 256-512 μg/mL against standard strains and clinical isolates. The relative minimum inhibitory concentration index (FIC) was equal to 1, which represents an increase in effect. Also, the minimum bactericidal concentration (MBC) was four times the minimum inhibitory concentration (MIC). The highest MIC was related to zinc oxide nanoparticles and the lowest was related to the simultaneous use of essential oil and nanoparticles. In the combined mode of treatments, half the MIC of separate treatments was required. Also, with the reduction of the effect m.

    Conclusion

    The results indicated that clinical strains were highly resistant to some antibiotics but sensitive to others. Also, Khuzestan savory essential oil and zinc oxide nanoparticles were effective against standard strains and clinical isolates. The main component of this essential oil was carvacrol, which has antimicrobial properties. The results showed that the combination of essential oil and nanoparticles led to a stronger and more effective reduction in lasR gene expression. The study concluded that the combination of Khuzestan savory essential oil and zinc oxide nanoparticles is a promising complementary and alternative therapeutic approach for the treatment of chronic Pseudomonas aeruginosa infections.

    Keywords: Pseudomonas aeruginosa, Silver nanoparticles, Khuzestan thyme essential oil, LasR, Biofilm
  • محمد زارع مهرجردی، نسیم صفری، سیده مهدیه خرازی، آزاده خادم، احمد شریفی*

    در طی رشد گیاه، کیفیت نور بر بسیاری از شاخص های مورفولوژیکی و فیزیولوژیکی تاثیر می گذارد. امروزه استفاده از نور تکمیلی به طور قابل توجهی عملکرد محصول و کیفیت آن را در شرایط کمبود نور طبیعی به خصوص در فصل های پاییز و زمستان بهبود می بخشد. دیودهای ساطع کننده نور (Light-emitting diode) به عنوان منابع نور جایگزین در محیط های کشاورزی کنترل شده پیشنهاد شده اند. در این راستا، پژوهش حاضر به منظور بررسی چگونگی تاثیر کیفیت نور بر دانهال های خیار (Cucumis sativus L.) رقم Officer در شرایط کنترل شده آزمایشگاهی انجام شد. آزمایش در 4 کیفیت متفاوت نور آبی، قرمز، سفید و ترکیبی (آبی+قرمز+سفید) با توانایی فتوسنتزی یکسان بود. نتایج تجزیه واریانس داده ها نشان داد که بین تیمارهای نوری از نظر صفات، ارتفاع بوته، سطح برگ، وزن خشک ریشه و وزن تر اندام هوایی تحت تاثیر کیفیت نور قرار گرفت و اختلاف بین آنها در روز های مختلف پس از کشت معنی دار بود. ارتفاع بوته در تیمار نور قرمز و نور آبی در مقایسه با تیمار سفید و تیمار نور ترکیبی (قرمز+آبی+سفید) به ترتیب 3/58 و 3/133 درصد افزایش داشت. کمترین ارتفاع بوته در تیمار نور ترکیبی مشاهده شد. این درحالی است که بیشترین وزن تر اندام هوایی در نورهای سفید و آبی، بیشترین سطح برگ در نورهای سفید و قرمز و بیشترین وزن خشک ریشه نیز در نور سفید مشاهد شد. صفات تحت تاثیر قرار گرفته جزء دسته صفاتی هستند که تحت تاثیر هورمون جیبرلین قرار می گیرند. به طور کلی مشخص گردید که رشد گیاه خیار تحت تاثیر کیفیت های مختلف نور قرار گرفته است و با توجه به هدف تولید و شرایط موجود می توان کیفیت نور مناسب برای کسب حداکثر سرعت رشد گیاه را انتخاب نمود.

    کلید واژگان: دیودهای ساطع کننده نور، صفات رشدی، نور آبی، نور قرمز، نور سفید
    M. Zare Mehrjerdi, N. Safari, M. Kharrazi, A. Khadem, A. Sharifi *
    Introduction

     In addition to providing the necessary energy for photosynthesis, light controls many plant metabolic processes. Nowadays, the use of supplemental light significantly improves the quality of the food product in the conditions of lack of natural light in the autumn and winter seasons. Light-emitting diodes have been proposed as alternative light sources in controlled agricultural environments. These lamps are the first light sources with the ability to control the light spectrum. Therefore, by controlling the light spectrum and matching the wavelength of LED lamps with the photoreceptors of the plant, the performance and quality of the plant is improved. Cucumber is one of the most important greenhouse plants and its seedlings are generally produced during the autumn and winter seasons, when natural light is relatively low; therefore, the use of supplementary light is required. The use of artificial light sources in fully controlled conditions can change and improve the growth conditions of the plant and also improve its quantitative and qualitative traits. In this research, the aim was to investigate the effect of different qualities of light on the morphophysiological indicators of cucumber seedlings.

    Materials and Methods

     This research was performed at the Horticultural Plants Biotechnology Department, Industrial Biotechnology Research Institute of Khorasan Razavi. First, the seeds of the cucumber plant (Cucumis sativus L. var. Officer) were planted in a planting tray, and placed under the light panel with different light treatments. The experimental treatments included four light qualities including white light (6000-6500K) blue light (460-470 nm), red light (625 nm) and combined light (blue + red + white). The amount of photosynthetic photon flux was considered the same in all light treatments, which was equal to 2.75 µol m-2 s-1 CO2 assimilation. Thirty days after planting of seeds, the growth of plants were measured in three stages every 10 days. In each stage, 4 plant samples were selected and then plant height, leaf area, fresh and dry weight of shoots and roots, plant dry matter index and leaf chlorophyll content were measured. Data preparation was done in Excel software, data analysis was done using JMP-8 software and treatment averages were compared using LSD test at 5% probability level.

    Results and Discussion

    The results of the experiments showed that the quality of light was significantly effective on the growth indicators of Cucumber plants. Plant height in red light and blue light treatments compared to the white light and combined light (red+blue+white with the same intensity) treatments, increased by more than 130% and 60%, respectively. The lowest height was observed in plants grown under combined light, 9 and 14.25 cm after 40 and 50 days of cultivation respectively. The exposure of cucumber seedlings to the red and combined lights recorded the highest and the lowest leaf area in the plants, 618.65 and 377.26 cm2 respectively. Also white light significantly improved the dry weight of the roots. It is worth to mention that the highest plant fresh weight was observed in blue and white lights, 20.9 and 19.5 g respectively. For parameters such as dry weight, dry matter index, and pigment content, the light treatments did not exert a significant effect. However, the utilization of red and blue light, both individually and in combination, positively impacted plant growth. Notably, exposure to red light alone led to a significant increase in leaf surface area, root dry weight, and plant height compared to other light conditions. Previous studies have indicated that red light enhances leaf area, stem length, and fresh weight of plants. Leaves play a critical role in plant photosynthesis and overall growth. Therefore, increasing the leaf area in the plant increases the amount of photosynthesis, growth and development of the plant. In this study, with the increases of the leaf area in the plant and the subsequent increases in the amount of photosynthesis, allocation of dry mater to root increased. The results of the research has been shown that the combination of blue and red wavelengths in pepper, tomato and cucumber seedlings is effective in stimulating plant growth and improving the morphological characteristics under controlled conditions. Blue and red lights can increase the proton flow rate of epidermal cells through the separation mechanism and thus affect leaf development. Blue light directly through the interaction with proton pumps and indirectly through receptors, affects proton pumps by modulating passive ion conduction of potassium and calcium channels.

    Conclusion

     According to the results of this research, it was found that exposing the plant to different light quality had different responses in the cucumber plants. Although variables such as dry weight and the amount of photosynthetic pigments were not significantly affected by light quality, however, traits such as plant height, leaf area, root dry weight, and plant fresh weight were affected by light quality. The affected parameters are among the traits that are influenced by the gibberellin hormone and according to the reports related to the effect of light quality on the gibberellin biosynthesis and response to this hormone. It seems that plant action to the quality of light can be attributed to the regulation of this hormone. So it is possible to choose the appropriate light quality in fully controlled conditions according to the production goal and results. In this research, according to the plant leaf rea, root dry weight and plant height, it was determined that white light can be used in the seedling production stage.

    Keywords: Blue light, Growth characteristics, Light emitting diodes, Red light, White light
  • عباس شریفی تهرانی*، عبدالمجید مهدوی دامغانی
    بهره گیری از فناوری های نوین و بوم سازگار نقشی کلیدی در افزایش بهره وری تولید، کاهش خسارت ها و بهینه سازی مدیریت زنجیره ارزش محصول های کشاورزی دارد. امروزه ورود فناوری های نوین و ارتقای روش های گذشته به ویژه با رشد سریع فناوری اطلاعات، از جمله موتورهای جست و جوگر، هوش مصنوعی، شبکه های اجتماعی، آموزش از راه دور، رایانش ابری، اینترنت اشیاء و رشد دیگر فناوری های شبکه پایه موجب آسان شدن ایجاد سامانه های برهمکنش گر و اشتراک اطلاعات شده است. این فناوری ها شرایط ورود به دروازه های جدیدی را برای مدیریت کارامد بخش کشاورزی گشوده است. دشواری های مهم ورود و توسعه فناوری های نوین در بخش کشاورزی ایران شامل جنبه های اقتصادی (مانند هزینه بالای سرمایه گذاری و تامین فناوری های نوین و نیروی کار حرفه ای)، زیرساختی (نبود بسترهای مناسب بهره گیری از فناوری های نوین، نبود پیوستگی بین حلقه های زنجیره بخش کشاورزی) و  اجتماعی و فرهنگی (کم بودن سطح سواد رسانه ای، ساختار سنتی و معیشتی جامعه کشاورزی و  تغییر سبک زندگی) است. بنابراین، راهبرد بنیادی برای بومی سازی فناوری های نوین عبارتنداز: آموزش استفاده از فناوری های نوین به کشاورزان، شناسایی و بررسی چالش ها و نیازهای واقعی پیش روی کشاورزان و بازیگران اصلی زنجیره کشاورزی از مزرعه تا سفره، ایجاد مزرعه های پژوهشی، ایجاد بسترها و زیرساخت های لازم برای ورود و بومی سازی فناوری های نوین.
    کلید واژگان: اینترنت اشیا، بومی سازی، زنجیره ارزش، فناوری اطلاعات
    A. Sharifi *, ABDOLMAJID MAHDAVI DAMGHANI
    Applying modern, eco-based and updated technologies has a key role in improving productivity, minimization of losses, as well as optimization of agricultural value chain management. Introduction of modern technologies, including IT, IoT, Artificial Intelligence, social networks, virtual education, and cloud computing facilitate science and information partitioning. The main constraints for introduction and application of these technologies in agriculture and natural resources sector in Iran include economic (high investment, provision and professional labor cost), infrastructural (lack of suitable platforms, weak interconnectedness between different parts of agricultural sector chain) and socio-cultural (low education, traditional and subsistence structure of agriculture in Iran and farmers lifestyle) factors. Results of present study shows that determining farmers and other stakeholders’ challenges for applying modern technologies, developing pilot farms and providing necessary structures are main strategies to promote and indigenize these technologies in agriculture and natural resources sector in Iran.
    Keywords: Information technology, Indigenization, Internet of Things, Value chain
  • S. Dastmalchi, N. Moshtaghi*, A. Sharifi

    MADS-box genes play important roles in the regulation of floral organ development. In this gene family, AGAMOUS genes are responsible for stamen and carpel development. In the double-flowered form of Amaryllis, compared to its wild type, the stamen number is reduced to three, there is no pistil, and, in contrast, tepal numbers have increased. In this investigation, we examined the AGAMOUS (AG) gene function in these alterations. Therefore, we isolated one AGAMOUS coding sequence named AmAG. Then, the expression level of this gene in the wild form and double-flowered Amaryllis was evaluated using quantitative real-time PCR. The phylogenetic results showed that the partial AmAG gene has high homology with the sequences of AGAMOUS ortholog genes in the Amaryllidaceae family and plants close to this family. Also, there were no differences in the sequence of partial AmAG genes in wild and double-flowered forms. Real-time PCR revealed that, in wild form, AmAG gene expression was low in the first to third whorl and high only in the fourth whorl. While in double flowered form, AmAG gene expression in four whorls was low. The lower expression of AmAG in the fourth whorl of double-flowered form had caused such morphological alterations, the reasons for which should be determined in other experiments.

    Keywords: Double flowered, Hippeastrum, MADS, Mutant gene
  • منا طهماسبی*، محمد گهری، احمد شریفی، ابوالفضل هدایتی پور

    فشردگی خاک می تواند به طور طبیعی اتفاق بیفتد یا ناشی از رفت و آمد ماشین‏ ها باشد. عملیات زیرشکنی اغلب برای سست کردن لایه تراکم خاک و کاهش مقاومت خاک تا سطوحی که امکان رشد و نمو ریشه را فراهم کند، استفاده می شود. عملیات زیرشکنی با عمق متغیر به طوری‏ که خواص فیزیکی خاک را تنها در مواردی که خاک ورزی برای رشد محصول مورد نیاز است اصلاح می کند، پتانسیل کاهش نیروی کار، هزینه ها، سوخت و انرژی مورد نیاز را دارد. از آن جایی که این مطالعه با هدف انجام عملیات زیرشکنی با عمق متغیر انجام شد، ابزار خاک‏ ورزی با عمق متغیر (VDT) طراحی و ساخته شد. یک حسگر پنوماتیکی مجهز به چند نازل برای پیش ‏بینی هم‏ زمان عمق لایه متراکم خاک در سه عمق (15، 30 و 45 سانتی‏ متر) و ارسال سیگنال برای کنترل عمق خاک ‏ورز VDT استفاده شده است. ارزیابی سامانه ابزار VDT به دو روش استاتیکی و دینامیکی انجام شد. در ارزیابی استاتیکی، زمان پاسخ سیستم برای رسیدن به 95 درصد عمق ‏های موردنظر اندازه گیری شد. ارزیابی دینامیکی زیرشکن نیز در دو مرحله انجام شد. میزان مصرف سوخت و مسافت رسیدن تیغه‏ های زیرشکن به عمق موردنظر در سه تکرار اندازه ‏گیری شد و با دستگاه زیرشکن (در حالت کنترل عمق خاموش) مقایسه گردید. میانگین مصرف سوخت در حالت عمق متغیر نسبت به عمق بیشینه ثابت به میزان 17.36 درصد کاهش پیدا کرد. همچنین سنجنده به‏ خوبی وارد خاک شده و فرمان کنترل را به سیلندر هیدرولیکی به طور پیوسته‏ ارسال می‏ کرد و دستگاه زیرشکن، خاک را در عمق ‏های ارسالی از سوی سنجنده زیرشکنی نمود.

    کلید واژگان: خاک ‏ورزی دقیق، خاک‏ ورز عمق متغیر (VDT)، حسگر پنوماتیکی، کاهش مصرف سوخت، لایه خاک متراکم
    M. Tahmasebi *, M. Gohari, A. Sharifi, A. Hedayatipour

    Soil compaction can be naturally occurred or can be machinery-induced. Subsoiling is often applied to loosen soil compaction and decrease soil strength to levels that allow for root development and growth. Variable-depth subsoiling which modifies the physical properties of soil only where the tillage is required for crop growth has the potential to reduce labor, costs and fuel, and energy requirements. Since this study aimed to perform subsoiling operations with variable depth, the variable-depth tillage (VDT) tool was developed. A pneumatic multi-nozzles sensor has been used to simultaneously predict the depth of a soil layer in three depths (15, 30, and 45 cm), and send a signal to control the depth of the VDT tool. Evaluation of the VDT tool system was performed by two methods namely static and dynamic tests. In static evaluation, the system response time was measured to reach 95% of the proposed depths. The dynamic evaluation of the tool was accomplished in two steps in the field. The amount of fuel consumption and the travel distance of the tool tine to reach the desired operation depth were measured and compared with the common subsoiler (when the depth control was OFF). The average fuel consumption by using the variable-depth tillage tool decreased by 17.36% compared to the constant depth. Furthermore, the pneumatic sensor tine penetrated into the soil perfectly and sent the control signal to the control unit of the VDT tool in real-time, and the VDT tool loosened the soil at the exact depths sent by the sensor.

    Keywords: Compacted soil layer, Fuel consumption reduction, Pneumatic sensor, Precision tillage, Variable-Depth Tillage (VDT) tool
  • M. Jalili, A. Sharifi *
    Medicinal plants are considered as valuable natural sources. In this study, the antibacterial properties of Cirsium congestum essential oil and methanolic extract were investigated against Escherichia coli, Bacillus cereus, Staphylococcus aureus, Candida albicans and Klebsiella pneumonia. The results of agar disc-diffusion method showed that essential oil and extract exhibited maximum and minimum inhibition zone diameter against Candida albicans and Escherichia coli respectively. Minimum inhibitory concentration (MIC) of essential oil and methanolic extract observed for Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Bacillus cereus, Candida albicans and Klebsiella pneumoniae respectively. Lowest MIC related to Candida albicans. Cirsium congestum essential oil had higher antibacterial activity in comparison with the extract. The chemical composition of the Cirsium congestum essential oil was analysed by gas chromatography mass spectrometry (GC–MS). Twenty-six compounds representing 99.98% of the total essential oil was identified. The Results showed sescoe turpen hydrocarbons and imidazole 4- propionic acid were the major compounds in Cirsium congestum essential oil.
    Keywords: Antibacterial, Cirsium congestum, Essential Oil, Extract, GC-MS
  • سمیرا نظری، ایوب عزیزی*، علی کیانی، افروز شریفی
    در این تحقیق، اثر سطوح مختلف کنجاله کاملینا بر عملکرد رشد، فراسنجه های تخمیر شکمبه ، متابولیت های خونی و رفتارشناسی تغذیه ای بره های نژاد لری-بختیاری بررسی شد. بدین منظور از 30 راس بره نر نژاد لری-بختیاری با بازه سنی چهار تا پنج ماهه و میانگین وزنی 5±5/34 کیلوگرم به مدت 70 روز استفاده شد. دام ها با سه جیره آزمایشی شامل سطوح صفر، پنج و 10 درصد کنجاله کاملینا که جایگزین کنجاله سویا شده بود و 10 تکرار (بره) در هر تیمار در قالب طرح کاملا تصادفی تغذیه شدند. نتایج نشان داد که با افزایش سطح کنجاله کاملینا در جیره، غلظت نیتروژن آمونیاکی شکمبه، اسید چرب پروپیونات و غلظت نیتروژن اوره ای خون به طور خطی افزایش یافت (05/0>P). هرچند، جیره های آزمایشی اثری بر pH شکمبه و غلظت سایر اسیدهای چرب فرار نداشت. میزان فعالیت آنزیم شکمبه اییای کربوکسی متیل سلولاز با افزایش سطح کنجاله کاملینا در جیره به طور خطی کاهش یافت (05/0>P)، اما فعالیت سایر آنزیم های شکمبه ای تحت تاثیر جیره های آزمایشی قرار نگرفت. جیره های غذایی تاثیری بر مصرف ماده خشک و NDF، وزن نهایی بدن و میانگین افزایش وزن روزانه نداشتند. به جز میزان نشخوار کردن و نسبت نشخوار کردن به ماده خشک مصرفی که با افزایش سطح کنجاله کاملینا در جیره به طور خطی افزایش یافت (05/0>P)، سایر صفات رفتارشناسی تغذیه ای تحت ثاثیر جیره های آزمایشی قرار نگرفتند. در کل، نتایج پژوهش حاضر نشان داد که استفاده از کنجاله کاملینا، به عنوان یک منبع پروتیینی جدید، به جای کنجاله سویا تا سطح 10 درصد ماده خشک جیره غذایی بره های پرواری قابل توصیه است.
    کلید واژگان: بره پرواری، تخمیر شکمبه، رفتارشناسی تغذیه ای، فعالیت آنزیمی، کنجاله کاملینا
    S. Nazari, A. Azizi *, A. Kiani, A. Sharifi
    Introduction
    In the animal husbandry industry, more than 70% of the production costs are related to nutrition. Among the nutrients consumed by livestock, protein is one of the most important and expensive nutrients. Due to Iran's limitations in the production of oilseeds and consequently the production of protein meals, providing the protein needs of livestock has been associated with many problems. The use of new and especially local protein sources in ruminant feeding is one of the main solutions to cover the lack of protein sources and reduce the import of these sources, and it also reduces production costs in the livestock and poultry industry. Camelina sativa medicinal-oil plant has attracted a lot of attention, especially in recent years, and its most important advantage is extreme resistance to drought and cold conditions. The presence of high amounts of crude protein (CP), energy, and essential amino acids in camelina meal makes it a useful and potential option for use in the livestock and poultry feed industry. It was shown that the CP content of camelina meal was 41.9% of dry matter. Also, camelina meal has higher CP content and similar rumen undegradable protein compared to canola meal. In terms of lysine and methionine amino acids, which are important in muscle growth, camelina meal is considered a rich source. Camelina is a plant with a short growth period of 85-100 days and recently in Iran at the beginning of the camelina development project, the DH1025 line was produced, which is cultivated under the name of Soheil variety on a wide scale. Various studies have been conducted on the use of camelina meal for different purposes in ruminant nutrition. This is while there is little information about the nutrition of camelina meal and especially Soheil variety in the nutrition of ruminants in Iran. Therefore, this research aimed to investigate the effects of different levels of camelina meal on growth performance, rumen fermentation parameters, blood metabolites, and nutritional behavior of Lori-Bakhtiari lambs.
    Materials and methods
    Thirteen Lori-Bakhtiari male lambs of four to five months of age with a mean live weight of 34.5±5 kg were used for 70 days of the experimental fattening period. Lambs were assigned to three experimental treatments (10 lambs per treatment) in a completely randomized design. Three experimental diets contained camelina meal at levels of zero (control), five, and 10% of dry matter (DM). Experimental diets were formulated according to nutritional requirement tables for small ruminants and were similar in terms of energy and protein. Also, the ratio of forage to concentrate in the diets was considered to be 30 to 70. From the first day, the animals were kept and reared in individual stalls. Two weeks before the start of the experiment (adaptation period), the lambs were vaccinated against enterotoxemia and the amount of 20 mL of anti-parasitic syrup (5% Clozantel) per 10 kg of body weight and niclosamide anti-parasitic syrup (seven to 10 mL per lamb) was fed to the lambs. Camelina meal used in this project was a genetically modified and localized variety. Experimental rations were provided in a completely mixed form (TMR) to the lambs daily at 8:00 am and 4:00 pm.
    Results and discussion
    Results showed that increasing the level of camelina meal in the diet increased linearly the concentration of ruminal ammonia, propionate, and blood urea nitrogen (P<0.05), while ruminal pH and other individual volatile fatty acids, and blood parameters were not affected by the experimental diets (P>0.05). The activity of carboxymethyl cellulase enzymes decreased linearly with increasing the level of camelina meal in the diet (P<0.05). However, the activity of other rumen microbial enzymes was not affected by the experimental diets (P>0.05). In terms of behavioral traits, diets had no effect on DM and NDF intake, and also final body weight and average daily gain (P>0.05). Except for the amount of rumination and the ratio of rumination to DM intake, which increased linearly with increasing the level of camelina meal in the diet (P<0.05), other nutritional behaviors were not affected by the experimental diets (P>0.05).
    Conclusions
    In general, the results of the present study showed that the use of camelina meal, as a new source of protein, instead of soybean meal up to 10% of dietary DM of fattening lambs is recommended.
    Keywords: Fattening lamb, Rumen fermentation, Nutritional behavior, Enzyme activity, Camelia meal
  • ااستراتژی کنترل عفونت های کمپلکس تنفسی باید عوامل ایجادکننده و مستعدکننده را به طور کلی و عوامل سرکوب کننده سیستم ایمنی را به طور خاص مورد بررسی قرار دهد. در هر دو شکل بالینی و تحت بالینی، ویروس بیماری بورس عفونی (IBDV) یکی از بیماری های سرکوب کننده سیستم ایمنی جوجه های جوان است. این مطالعه با هدف بررسی عفونت همزمان گامبورو و عفونت های کمپلکس تنفسی فیلدی ناشی از ویروس بیماری نیوکاسل (NDV) و متاپنوموویروس پرندگان (aMPV) در جوجه های گوشتی انجام شد. در طی این مطالعه، 20 فارم گوشتی با علایم تنفسی تایید شده انتخاب شدند و 800 نمونه بافت (شامل نای ، سکال تونسیل، بورس فابریسیوس، طحال) و 400 نمونه سرم جمع آوری شد. تشخیص پاتوژن ها در نمونه های بافتی با استفاده از RT-PCR برای ژن VP2 ویروس گامبورو، ژنF ویروس نیوکاسل و جفت ژن های Nd / Nx متاپنوموویروس پرندگان انجام شد. محصولات تقویت شده توالی یابی شدند. در پایان دوره پرورش، از نمونه-های خون برای تشخیص آنتی بادی علیه IBDV و aMPV با استفاده از ELISA و علیه NDV با استفاده از آزمایشات HI استفاده شد. نتایج مولکولی نشان داد که نمونه های بافتی برای سویه های IBDV ، NDV و aMPV به ترتیب 45 درصد (20/9)، 30 درصد (20/6) و 15 درصد (20/3) مثبت بودند. در خصوص عفونت هم زمان IBD و ND ، 5٪ (20/1) از جدایه های فیلدی مثبت بودند در حالیکه 10٪ (2/20) فارم ها از نظرعفونت هم زمان IBD و aMPV مثبت بودند. عفونت هم زمان IBD ، ND و aMPV مشاهده نشد. نتایج سرولوژیک نشان داد که گله های آلوده به IBD تیتر آنتی بادی بالاتر (05/0> p) بر علیه ویروس IBD داشتند، اما گله های آلوده به IBD-NDV تیتر آنتی بادی کمتری بر علیه NDV داشتند و گله های آلوده به IBDV-aMPV دارای تیتر آنتی بادی کمتری بر علیه aMPV داشتند.نتیجه گیری. IBD تحت بالینی بر تیتر آنتی بادی علیه NDV و aMPV در جوجه های گوشتی تاثیر می گذارد، بنابراین واکسیناسیون بر علیه IBD برای کاهش اثرات سرکوب کننده سیستم ایمنی ناشی از IBD تحت بالینی و بهبود پاسخ های ایمنی بر علیه این بیماری ها در طی برنامه های واکسیناسیون حتی در مناظقی که گامبور بالینی مشاهده نشده اجتناب ناپذیر است.

    A. Sharifi, M .Allymehr *, A .Talebi

    Control strategy of respiratory complex infections should address precipitating and predisposing causative agents in general and immunosuppressive agents in particular. In both clinical and subclinical forms, infectious bursal disease virus (IBDV) is one of the most immunosuppressive diseases of young chickens. This study aimed to investigate the concurrent occurrence of subclinical infectious bursal disease (IBD) and multicausal respiratory complex infections caused by Newcastle disease virus (NDV) and avian metapneumovirus (aMPV) in broilers. In this study, 800 tissue samples (e.g., trachea, cecal tonsil, bursa of Fabricius, and spleen) and 400 sera samples were collected from broilers with confirmed respiratory signs selected from 20 broiler farms in west Azerbaijan province, Iran, from October 2018 to February 2019. Pathogens in the tissue samples were detected using RT-PCR for the VP2 gene of IBDV, F gen of NDV, and N gene of aMPV. The amplified products were sequenced afterward. At the end of the husbandry period, sera samples were used to detect antibodies against IBDV, aMPV, and NDV using ELISA and HI tests. Molecular results showed that the 45% (9/20), 30% (6/20), and 15% (3/20) of tissue samples were positive for IBDV, NDV, and aMPV, respectively. Regarding co-infection, 5% (1/20) of farm isolates were positive for IBD and ND, while 10% (2/20) of farms isolates were positive for IBD and aMPV. Co-infection of IBD, ND, and aMPV was not detected in farm isolates. Serological results indicated that the IBD co-infected flocks had almost higher (P<0.05) antibody titers against IBD; however, IBDV-NDV co-infected flocks and IBDV-aMPV co-infected flocks had lower antibody titer against NDVand aMPV, respectively. It can be concluded that lower antibody titer against ND and aMPV in IBD-ND and IBD-aMPV co-infections indicated suppressive effects of IBD on these diseases. Therefore, vaccination against IBD even in regions without clinical form of IBD is inevitable for the reduction of immunosuppressive effects of subclinical IBD on immune responses against these diseases.

    Keywords: Avian metapneumovirus, Broiler, Bursal disease virus, Newcastle disease, Respiratory complex
  • احمد شریفی، مریم مرادیان، نسیم صفری، آزاده خادم، سیده مهدیه خرازی*

    امروزه استفاده از گیاهان برگ زینتی در فضای آپارتمان برای زیباسازی فضا و طراحی فضای داخلی امری رایج است. بنابراین، تعیین بهترین روش تکثیر با هدف تولید تعداد زیاد گیاه در مدت زمان کوتاه، در این گیاهان امری ضروری است. بدین منظور آزمایشی برای ریزافزایی گیاه برگ زینتی سینگونیوم طراحی و اجرا گردید. در راستای درصد باززایی ریزنمونه های گره با طول یک سانتی متر در محیط کشت نیمه جامد MS حاوی غلظت های مختلف تنظیم کننده رشد گیاهی BA و Kin قرار داده شدند. به منظور بررسی درصد پرآوری ریزنمونه ها آزمایشی در قالب طرح فاکتوریل بر پایه طرح کاملا تصادفی با پنج تکرار انجام شد. عامل اول شامل نوع محیط کشت (MS و B5) و عامل دوم غلظت های مختلف آن (0/5 و 1) بود. در آزمایش سوم، به بررسی سازگاری گیاهچه ها با استفاده از بسترهای کشت مختلف پرداخته شد. این آزمایش به صورت طرح کاملا تصادفی انجام شد. با توجه به نتایج آزمایش، مشخص گردید که استفاده از سیتوکینین در محیط کشت پایه MS بر باززایی گیاه موثر است. بیشترین تعداد گیاهچه باززاشده در محیط کشت حاوی 4 میلی گرم  بر لیتر BA به همراه 0/2 میلی گرم بر لیتر IAA مشاهده شد. همچنین، با افزایش غلظت BA در محیط کشت، از ارتفاع گیاه کاسته شد اما تعداد گیاهچه تولیدی در آن افزایش یافت. در مقایسه دو محیط کشت MS و B5، مشخص گردید که استفاده از محیط کشت نصف غلظت MS در مرحله پرآوری در این گیاه به دلیل بهبود صفات رشدی مانند ارتفاع گیاهچه و طول ریشه مناسب است. در مرحله سازگاری استفاده از بستر کشت ورمی کولایت + پیت ماس منجر به سازگاری صد درصدی گیاهان و بهبود صفات رشدی در گیاه گردید.

    کلید واژگان: باززایی، بستر کشت، پرآوری، سازگاری، سینگونیوم
    A. Sharifi, M. Moradiyan, Nasim Safari, A. Khadem, M. Kharrazi *
    Introduction

    Ornamental foliage plants are commonly used for beautifying indoor spaces. Consequently, determining the best method of mass propagation in a short time, is necessary for these plants. For this purpose, an experiment was designed and performed to micropropagate the Singonium ornamental plant.

    Materials and Methods

    For the first stage, the effect of different plant growth plant growth regulators on the regeneration of nodule explants was evaluated. In this experiment, 1 cm nodal explants were placed in semi-solid MS culture medium containing different concentrations of BA and Kin (0, 1, 2, 3 and 4 mg/l) in combination with 0.2 mg/l IAA. This experiment was performed as a factorial based on a completely randomized design with four replications. The first factor included different types of cytokinin (BA and Kin) and the second factor included different concentrations (0, 1, 2, 3 and 4 mg/l). In the second stage, the effect of different types of culture medium and its different concentrations on plantlet proliferation was investigated. This study was performed as a factorial experiment based on a completely randomized design with five replications. The first factor included the type of culture medium (MS and B5) and the second factor was the different concentrations of culture medium (0.5 and 1). In the third stage of the experiment, the acclimation of in vitro plantlet was investigated. This experiment was performed as a completely randomized design with three replications. The experimental treatments included different culture media: vermiculite, peat moss, vermiculite + peat moss, perlite + peat moss, perlite, coco peat + vermiculite, coco peat + perlite, coco peat and rock wool.

    Results and Discussion

    According to the results of the first experiment, it was found that the use of cytokinin in MS culture medium is effective on plant regeneration. The highest number of regenerated plantlet was observed in culture medium containing 4 mg/l BA with 0.2 mg/l IAA. It is noteworthy that with increasing BA concentration in the culture medium, the plant height decreased, but in contrast, the number of produced plantlets increased. Benzyl aminopurine (BAP) has been introduced as the most important and effective cytokinin in inducing and increasing branching in plants. Research has shown that the use of external benzyl adenine affects plant growth by affecting plant cells or by controlling the accumulation of a number of cytokinin compounds. As a result, the use of cytokinins in culture medium under in vitro culture conditions is necessary to induce and increase cell division. According to the second experimental results, produced plantlets in MS culture medium had higher height, number of roots and root length compared to B5 culture medium. Results also demonstrated that the use of ½ MS in the propagation stage of this plant is appropriate due to the improvement of growth traits such as plantlet height and root length. The use of optimal and suitable culture medium is very effective in the success of plant micropropagation. In the present study, the use of MS culture medium showed better performance compared to B5 culture medium. The appropriate amount of components, better ion strength and more minerals in this culture medium compared to B5 culture medium are probably the factors influencing its superiority in in vitro culture. In the acclimation stage, the use of vermiculite + peat moss culture medium led to 100% adaptation of plants and improvement of growth traits in the plant.

    Conclusion

    The results showed that the type and concentration of cytokinin had a significant effect on the most of the evaluated parameters. With increasing the concentration of cytokinin in the culture medium, the number of regenerated plantlet was increased, but on the other hand, the height of regenerated plantlet also decreased. The use of culture medium containing BA compared to KIN had a more pronounced effect on increasing the number of regenerated plantlets. Application of MS medium compared to B5 medium was more effective in increasing plantlet height, root length, number of roots and number of produced plantlets. Also, half-strength MS medium, increased plantlet height and root length. Therefore, at this stage of propagation, the application of ½ MS culture medium is recommended. In the acclimation stage, it can be stated that the use of vermiculite substrate in combination with peat moss is a suitable option considering 100% compatibility of syngonium plantlets and improvement of growth traits in comparison with other substrates.

    Keywords: Adaptation, Culture medium, Regeneration, reproduction, Syngonium
  • صدیقه مرادی، غلامعباس سبز، سیده ندا خرم روز، نسیم میرزایی، سید رضا چراغ زاده، محمدامین قطعی، مرجان صلاحی، اصغر شریفی، فرزاد مظلومی راد، محسن نغماچی، مهدی میرزایی، سحر میلانی، سید سجاد خرم روز*
    زمینه و هدف

    هایپرتروفی آدنویید یکی از مشکلات دوران کودکی است که باکتری ها در اتیولوژی آن دخیل هستند. هدف از این مطالعه تعیین فراوانی نسبی بیوفیلم و ژن های مرتبط با تشکیل بیوفیلم در ایزوله های استافیلوکوکوس اریوس و هم چنین تعیین الگوهای ژنوتیپیجفت ایزوله های استافیلوکوکوس اریوس از آدنویید و لوزه کودکان مبتلا به هایپرتوفی آدنویید با روشSpa typing بود.

    روش بررسی

    این یک مطالعه توصیفی مقطعی می باشد که در سال 1397 1396 در بیمارستان امام سجاد شهر یاسوج، بر روی 86 جفت ایزوله استافیلوکوکوس اریوس جدا شده از لوزه و آدنویید کودکان مبتلا به هایپرتورفی آدنویید انجام شد. روش فنوتیپی توانایی استافیلوکوکوس اریوس در تولید بیوفیلم سنجیده شد و با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلیمراز(PCR) ژن های icaA، icaD، fnbA و clfA ارزیابی شدند. به منظور تایپینگ ایزوله های استافیلوکوکوس اریوس از روش spa تایپینگ استفاده شد. داده ها با استفاده ازآزمون های آماری توصیفی تجزیه و تحلیل شدند.

     یافته ها

    استافیلوکوکوس اریوس های جدا شده از آدنویید و لوزه به ترتیب در 49(57 درصد) و 40 (5/46 درصد) بیوفیلم  مثبت بودند. در 47 مورد جفت ایزوله های جدا شده از آدنویید و لوزه از لحاظ تولید بیوفیلم مشابه بودند. بالاترین فراوانی ژنها مربوط به fnbA بود که در آدنویید در 64 درصد  و در لوزه در در 9/41 درصد ایزوله ها شناسایی شد. در مطالعه حاضر 4 نوع تیپ spa در استافیلوکوکوس اریوس شامل تیپ t081 غالبترین تایپ در 5/67 درصد، t701  در 6/11 درصد، t2419 در 3/9 درصد و  t4870  در 2/8 درصد از  ایزوله های آدنویید شناسایی شدند. در مجموع 45/79 درصد جفت ایزوله آدنویید و لوزه دارای تیپ بندی مشابهی بودند.

     نتیجه گیری

    با توجه به فراوانی نسبی تشکیل بیوفیلم، بیوفیلم اهمیت متوسطی در استقرار استافیلوکوکوس اریوس در لوزه و آدنویید بیماران دارد. هم چنین نقش ژن fnbA  در مقایسه با سایر ژن های مورد مطالعه در تشکیل بیوفیلم بیشتر از سایرین بود. مشابهت بالای spa تایپ های استافیلوکوکوس اریوس جدا شده از آدنویید و لوزه، نشان دهنده کلونیزاسیون اولیه باکتری در لوزه است و سپس به عنوان منبع عفونت برای آدنویید عمل می کنند.

    کلید واژگان: استافیلوکوکوس ارئوس، بیوفیلم، اسپاتایپینگ، آدنوئید
    S Moradi, GH Sabz, SN Khoramrooz, N Mirzaii, MA Ghatee, M Ghatee, M Salahi, A Sharifi, F Mazlumirad, M Naghmachi, M Mirzaii, S Milani, SS Khoramrooz*
    Background & aim

    Adenoid hypertrophy is one of the childhood complications in which bacteria are involved in its etiology. The aim of the present study was to determine the relative abundance of biofilms and genes associated with biofilm formation in Staphylococcus aureus isolates and also to determine the genotypic patterns of S. aureus isolates from adenoids and tonsils of children with adenoid hypertrophy by Spa typing method.

    Methods

    The present cross-sectional study was conducted on 86 pair isolates of S. aureus collected from adenoid and tonsil of children with adenoid hypertrophy. Phenotypic method used for assessing of biofilm production in S. aureus isolates and the presence of icaA,icaD,fnbA and clfA genes evaluated using polymerase chain reaction method. The spa typing method was apllied for typing of isolated. Data were analyzed using descriptive statistics method and SPSS software.

    Results

    S. aureus isolated from adenoids and tonsils were positive in 49 (57%) and 40 (46.5%) biofilms, respectively. In 47 cases, pairs of isolates from the adenoids and tonsils were similar in terms of biofilm production. In the present study, 4 types of spa types were identified in S. aureus including t081 type, the most dominant type in 67.5%, t701 in 11.6%, t2419 in 9.3% and t4870 in 8.2% of adenoid isolates. In total, 79.45% of adenoid and tonsil isolates had similar typing. highest frequency of genes was related to fnbA, which was detected in adenoids in 64% and in tonsils in 41.9% of isolates.

    Conclusion

    Due to the relative frequency of biofilm formation, biofilm is of moderate importance in the establishment of Staphylococcus aureus in the tonsils and adenoids of patients. Moreover, the role of fnbA gene in biofilm formation was higher than other studied genes. High spa similarity Staphylococcus aureus isolates isolated from the adenoids and tonsils indicate the initial colonization of bacteria in the tonsils and then act as a source of infection for the adenoids.

    Keywords: S. aureus, Biofilm, spa typing, Adenoid
  • حسن اردکانی، سید عبدالمجید خسروانی، افشین منصوریان، سهیلا جاهدی، اصغر شریفی*
    زمینه و هدف

    با توجه به مقاومت میکروارگانسیم ها نسبت به مواد ضدمیکربی، تلاش برای جایگزین نمودن مواد طبیعی گیاهی که خواص ضدمیکربی داشته باشند و عوارض جانبی این مواد نسبت به مواد شیمیایی کمتر باشد، به وسیله محققین در حال انجام است. یکی از روش هایی که برای نگهداری طولانی مدت موادغذایی استفاده می شود، اضافه کردن مواد ضدمیکروبی به موادغذایی است؛ لذا هدف از این مطالعه تعیین اثر ضدمیکروبی عصاره هیدروالکلی گیاه پنیرک (Malva Sylvestris L.) به عنوان نگهدارنده مواد غذایی بود.

     روش بررسی

    این پژوهش یک مطالعه تجربی آزمایشگاهی است که در سال 1395 انجام شد، چندین آزمایش مانند ژل دیفیوژن و چاهک اندازه گیری MIC و MLC انجام گرفت تاخواص نگهداری موادغذایی که به وسیله تعدادی از میکروارگانیسم ها که بیشتر باعث آلودگی مواد غذایی می شوند، با عصاره گیاه پنیرک بررسی شود. بعداز تهیه عصاره هیدروالکلی این گیاه بر روی محیط کشت های حاوی آب گوجه، آب انگور، آب آناناس  و آردگندم که با باکتری های استاف اوریوس، اشرشیا کلای و قارچ کاندیدا آلبیکنس و آسپرژیلوس نیجر آلوده شدند اثر داده شد. هم چنین حداقل غلظت مهار کنندگی رشد و حداقل غلظت کشندگی  این عصاره  و هم چنین سدیم بنوات روی میکروارگانیسم ها اندازه گیری و سپس قطر هاله عدم رشداین عصاره باآنتی بیوتیک های استاندارد مقایسه گردید. داده های جمع آوری شده با استفاده از آزمون های آماری شاخص های مرکزی، پراکندگی، جداول توزیع فراوانی و نمودارها تجزیه و تحلیل شدند.

     یافته ها 

    این مطالعه نشان داد که در غلظت 16، 8، 4، 2 و 1  میلی گرم بر میلی متر از عصاره این گیاه قطر هاله عدم رشد برای استاف اوریوس به ترتیب برابر با؛ 20، 18، 15 و 12 و 6 میلی متر و برای اشرشیاکلای هاله قطر هاله عدم رشدی مشاهده نشد. برای قارچ های آسپرژیلوس نیجر و کاندیداآلبیکنزMIC  و MLC به ترتیب برابر؛ 25، 31 و125 میلی گرم بر میلی متر و هم چنین رشد کلیه میکروارگانیسم ها در مقابل سدیم بنزوات در غلظت 2 میلی گرم بر میلی متر متوقف گردید و قطر هاله عدم رشد از 20 تا 28 میلی متر مشاهده شد.

     نتیجه گیری

    نتایج نشان داد که این عصاره در ترکیب با افزودنی های شیمیایی که توسط باکتری استاف آلوده شده بودند، اثر نگهدارندگی بالایی از خود نشان داده است، ولی موادی که با باکتری اشرشیا کلی آلوده شده بودند، تاثیری روی آنها نداشت. هم چنین این عصاره روی مواد غذایی که به وسیله قارچ ها آلوده شده بودند، اثر خوبی از خود نشان داد؛ ولی در مقایسه با سدیم بنزوات اثر این عصاره روی تمامی میکروارگانیسم ها کمتر بود. به هر حال امیدواریم در آینده با کارهای بیشتری که روی این گیاه صورت می گیرد، بتوان از این گیاه به عنوان جایگزینی مناسب برای نگهداری مواد غذایی به جای افزودنی های شیمیایی استفاده کرد.

    کلید واژگان: عصاره گیاه پنیرک، میکروارگانیسم، خاصیت ضدمیکروبی
    H Ardakani, SA Khosravani, A Mansourian, S Jahedi, A Sharifi*
    Background & aim

    Due to the resistance of microorganisms to antibacterial agents, efforts are being made by researchers to replace the plant natural substances with antimicrobial properties and lower side effects. The aim of this study was hydro alcoholic extract of malva sylvestris as a food preservative with some microorganisms, which further cause contamination of food products

    Methods

    The present experimental laboratory study was conducted in 2016. Several experiments, such as gel diffusion and MIC and MLC measurements were performed to evaluate the storage properties of nutrients by a number of microorganisms that are more likely to contaminate food with malva sylvestris extract. After preparing the hydro alcoholic extract, it was applied to the culture medium containing tomato juice, grapefruit juice, pineapple juice and wheat flour, which were infected with Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Candida albicans and Aspergillus Niger. Correspondingly, the minimum growth inhibitory concentration and the minimum lethal concentration of extract as well as sodium benzoate were measured on above microorganisms and then the diameter of the growth inhibition zone of extract was compared with standard antibiotics. The collected data were analyzed using descriptive statistical tests, i.e. the average of tables and graphs.

    Results

    The present study indicated that at concentrations of 1, 2, 4, 8, and 16 mg/mm of the extract, the diameter of the growth inhibition zone for S. aureus is equal to; 6, 12, 15, 18, and 20 respectively but growth aura was observed for E. coli. On the hand  the MIC and MBC  of extract  at concentrations of  1, 2, 4, 8, and 16 against Aspergillus Niger and Candida Albicans was 25, 31, and 125 mg/ml. however, the growth of all microorganisms against sodium benzoate at a concentration of 2 mg / mm was stopped and the diameter of the growth inhibition zone was observed from 20 to 28 mm..

    Conclusion

    The results indicated that this extract in combination with chemical additives contaminated with S. areus revealed a high retention effect, but substances contaminated with E. coli had no effect on them. Also, this extract had a good effect on foods contaminated with fungi, but compared to sodium benzoate, this extract had less effect on all microorganisms. However, we hope that in the future, with more work being done on this plant can be used as a suitable alternative to food storage instead of chemical additives.

    Keywords: Cheese extract, microorganism, antimicrobial properties
  • محمد رسولی نیا، علیرضا شریفی*

    کشت سیب زمینی به عنوان یکی از محصولات کشاورزی جایگاه ویژه ای در سبد غذایی انسان ها دارد و پس از ذرت و گندم، سومین منبع غذایی در جهان است. مدل های سنتی کشت سیب زمینی محدودیت هایی از قبیل هزینه زیاد، به دست آوردن داده ورودی مورد نیاز و کمبود اطلاعات مکانی در برخی موارد باعث شد که این مدل ها به فراموشی سپرده شوند. با تکیه بر علوم نوین و فناوری های جدید، پیشرفت های چشمگیری درزمینه تولید و کیفیت محصولات زراعی رخ داده است. هدف از انجام این پژوهش مشخص نمودن بهترین بازه زمانی باهدف تولید مدل های تخمین برای محصول سیب زمینی و همچنین تعیین بهترین الگوریتم برای مدل سازی و درنهایت دستیابی به بهترین دقت برای پیش بینی میزان محصول تولیدی و کیفیت آن هست. در کنار این موارد تاثیر عوامل زمینی مانند آبیاری، سم پاشی، کود دهی و میزان بارش نیز به عنوان فاکتورهای موثر مورد بررسی قرار گرفته است. هدف از این تحقیق ادغام داده های ماهواره ای و داده های زمینی بر روی 40 سایت کشت سیب زمینی در شهرستان سراب استان آذربایجان شرقی جهت تخمین محصول قابل برداشت است. از تصاویر ماهواره ای سنتینل-2 که برای استخراج شاخص NDVI اراضی مورد مطالعه استخراج شد و میزان همبستگی آن ها با داده های زمینی به دست آمد. بیشترین همبستگی در تاریخ 28 خرداد به میزان 0.48 بود. دلیل پایین بودن این همبستگی غده بودن سیب زمینی و تاثیر کم سبزینگی روی محصول تولیدی می باشد. برای مدل سازی از چهار الگوریتم یادگیری ماشین استفاده شد که روش فرآیند گوسی بهترین نتایج را بهمراه داشت (0.61R2=). نتایج نشان داد که برای افزایش دقت مدل سازی و تولید مدل های تخمین می توان از داده های ماهواره ای با رزولوشن بهتر استفاده کرد تا نتایج بهتری تولید شود و همچنین می توان تعداد اراضی که به عنوان داده آموزشی برای مدل سازی استفاده می شدند را بالا برد تا مدلی دقیق تولید گردد.

    کلید واژگان: تخمین محصول سیب زمینی، سنجش از دور، سنتینل-2، شاخص طیفی، رگرسیون
    M. Rasoulinia, A. Sharifi*

    In recent years, the worldchr('39')s population has been growing, reaching about 7.7 billion in 2018. In the next five years, the worldchr('39')s population will increase to about ten billion, thus increasing the demand for food, water resources and fertile land for food production. Therefore, precision agriculture is trying to improve the quantity and quality of agricultural products by using new technologies. Precision farming is a new concept in modern agriculture and is based on the existence of heterogeneity at the farm level. One of the reasons for the growth of precision agriculture among scientists and farmers is the advancement of technology in various fields such as global coordinate system, imaging sensors and spatial information management tools. The use of remote sensing allows us to control a very large space in a very short time, which will reduce heavy costs. Along with rice and wheat, potatoes are the third most important food crop in the world, fed by more than one billion people, and the demand for this crop has increased as the population has grown; Therefore, better methods of product protection and management need to be used to improve production. In order to build the whole model, the images of the region were considered during the months of March to October in a period of two years, and pre-processing such as removing the cloud and other errors were done in order to have images with the least error. The NDVI index was then calculated using red and infrared bands (Figure 3). By calculating the NDVI index, useful information about the plant such as health, plant vigor, presence or absence of fall, and proper irrigation were obtained. On the other hand, land information, agricultural lands have been collected through questionnaires. For modeling, we deal with two sets of terrestrial and satellite data. Separate use of each of them will be associated with shortcomings and shortcomings; Therefore, for modeling, a combination of terrestrial and satellite information was used to build a model with minimal deficiencies and defects. It is common for modeling to work repetitively to obtain the best algorithm, so linear regression is the best choice for modeling. Univariate method was used for modeling and the date of 28 June was selected as the modeling interval. Because using multivariate methods, due to the fact that there was a high correlation in the information of different time periods, a lot of duplicate information was generated, and for this reason, we used the univariate method. Four machine learning algorithms were used for modeling, which Gaussian methods and support vector showed the best results. According to the production estimation model, it is possible to predict the amount of potatoes produced in each agricultural land and its health status with 50% accuracy three months before the harvest. The results of this study showed that estimation models will provide very valuable information for better management of crops to be used by agricultural planners to avoid wasting resources and prevent imports.

    Keywords: Sentinel-2, Yield Estimation, Potato, Machine Learning Regression
  • مهدیه خرازی، احمد شریفی*، صبا نجاتی زاده، آزاده خادم، مریم مرادیان

    با توجه به وقوع خشکسالی‌های پی‌در‌پی در کشور و لزوم مصرف بهینه آب، بکارگیری فناوری‌های نوین نظیر سیستم‌های کشت هیدروپونیک بسته به منظور افزایش کارایی مصرف کود و آب نقش موثری در کاهش هزینه‌های تولید و افزایش عملکرد در واحد سطح خواهد داشت که در این میان انتخاب بستر کشت مناسب می تواند بسیار تاثیرگذار باشد. لذا پژوهش حاضر با هدف انتخاب بستر کشت بهینه جهت پرورش گیاهچه‌های کشت بافتی ژربرا در سیستم کشت هیدروپونیک بسته انجام شد. گیاهچه‌ها پس از طی نمودن مرحله سازگاری در سیستم‌های مختلف کشت گردیدند: سیستم بستر کشت یکپارچه به صورت سیستم بسته حاوی بسترهای کشت مختلف (پرلیت شکری، ورمی‌کولیت، ورمی‌کولیت: پرلیت، کوکوپیت: پرلیت، پشم سنگ) و سیستم کشت هیدروپونیک NFT6 به صورت سیستم بسته انجام شد. آزمایش بصورت طرح کاملا تصادفی با 6 تیمار (کوکوپیت: پرلیت، ورمی‌کولیت: پرلیت، پشم سنگ، ورمی‌کولیت، پرلیت شکری در بستر کشت یکپارچه به صورت سیستم بسته، سیستم کشت هیدروپونیک NFT به صورت سیستم بسته) در 6 تکرار انجام شد. طی یک دوره 6 ماهه پارامترهای مختلف رشدی مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج نشان داد که گیاهچه‌های کشت شده در بستر کشت ورمی‌کولیت و ورمی‌کولیت: پرلیت در مقایسه با سایر بسترهای کشت سریعتر وارد مرحله زایشی شدند و تعداد گل بیشتری را نیز تولید نمودند. گیاهچه‌های کشت شده در بستر کشت پشم سنگ عملکرد مطلوبی را از خود نشان ندادند که احتمالا تنش خشکی وارده بر گیاهان دلیل این امر می تواند باشد. همچنین از آنجا که گیاه ژربرا دارای ریشه‌های حجیمی می‌باشد، ریشه‌های این گیاه در سیستم NFT نتوانستند بخوبی توسعه پیدا کنند، لذا کاربرد سیستم  NFTنیز جهت پرورش گیاه ژربرا مناسب نمی‌باشد. بهترین عملکرد نمونه‌های گیاهی در بستر کشت ورمی‌کولیت حاصل شد ولی با توجه به عدم اختلاف معنی‌دار این بستر کشت با بستر کشت ورمی‌کولیت: پرلیت، به منظور کاهش هزینه‌های تولید، کاربرد بستر کشت ورمی‌کولیت: پرلیت در سیستم بسته جهت پرورش گیاه ژربرا توصیه می‌گردد.

    کلید واژگان: سیستم هیدروپونیک بسته، سیستم NFT، قطر طبق گل، بستر کشت یکپارچه
    M. Kharrazi, A. Sharifi*, S. Nejatizadeh, A. Khadem, M. Moradian
    Introduction

    Considering the occurrence of successive droughts in our country and the necessity of optimal water consumption, the use of modern technologies such as closed systems to increase the efficiency of fertilizer and water use will have an effective role in reducing production costs and increasing yield. The Nutrient Film Technique (NFT) system is one of the hydroponic culture systems in which the nutrient solution is circulated continuously. In this system, a thin layer of nutrient solution will be available to the plant roots, which has a significant effect on reducing fertilizer and water consumption.

    Materials and Methods

    The present study was conducted to select an optimal system for cultivation of Gerbera plantlets. Plantlets were cultivated in different systems after the acclimation stage: Integrated bedding system as a closed system containing different culture media (Perlite, vermiculite, vermiculite: perlite, cocopeat: perlite and rock wool) and NFT hydroponic system as a closed system. For fertilization, the following fertilizer combination (mM) was used: K2SO4 (0.22), KNO3 (3.62), KH2PO4 (0.71), NH4H2PO4 (0.35), NH4NO3 (0.53), Ca (NO3)2,4H2O (1.48), MgSO4, 7H2O (0.4), MnCl2, 4H2O (0.0049), H3BO3 (0.020), ZnSO4 (0.0061), CuSO4, 5H2O (0.00048), NaMoO4, 2H2O (0.00058), FeSO4, 7H2O (0.0348), Na2EDTA (0.0384). The experiment was conducted in a completely randomized design with six treatments in six replicates. During six months, the growth parameters of the plants including number of leaves, petiole length, fresh and dry shoot weight, leaf chlorosis percentage, leaf necrosis percentage, flower number, flower diameter, flowering stem height, number of days to flowering, end diameter of the stalk and the middle diameter of the stalk were evaluated. Data preparation was done in Excel and data analysis was performed using the Jump 8 software. Mean comparison between treatments was performed with LSD test at 5% probability level and charts were drawn using the Excel program.

    Results and Discussion

    The results showed that there was a significant difference between treatments for the number of leaves (p <0.01). Seedlings cultivated in the vermiculite culture medium produced the highest number of leaves; however, there was no significant difference between seedlings cultured in vermiculite and vermiculite: perlite media. The lowest number of produced leaves was observed in plantlets grown in the NFT system. Also, the seedlings grown in the rock wool medium had no significant difference with the NFT system. In this regard, the drought stress on plants and the consequent poor growth of plantlets reduced the number of produced leaves. The percentage of necrotic leaves in the NFT system was more than twice the vermiculite culture medium. There was no significant difference between cocopeat: perlite, perlite, rock wool, and NFT systems. Also, the lowest amount of necrotic leaves was found in the vermiculite culture medium, which did not have a significant difference with vermiculite: perlite culture medium. Low levels of leaf necrosis in these treatments indicate the optimal absorption of nutrients and the proper growth of plantlets in these culture media. The results showed that plantlets cultivated in the vermiculite and vermiculite: perlite flowered more quickly than other culture media and also produced more flowers. Plantlets grown in the rock wool medium did not show the desirable performance, which is due to drought stress. Besides, the use of cocopeat in the culture medium did not have a beneficial effect on plants. Measuring the initial electrical conductivity in the cocopeat culture medium also indicates a high EC concentration in this culture medium, which could affect the growth parameters of the plant and lead to poor vegetative growth of plantlets. Since Gerbera plant has bulky roots, the roots of this plant cannot be developed well in the NFT system, so the use of the NFT system is not suitable for Gerbera cultivation. The best performance of plant samples was obtained from vermiculite culture media, but since there were no significant differences between vermiculite and vermiculite: perlite, so to reduce production costs, the use of vermiculite: perlite culture medium in the closed system is recommended for the cultivation of Gerbera plant.

    Conclusion

    Since Gerbera plant has bulky roots, the roots of this plant cannot be developed well in the NFT system, so the use of the NFT system is not suitable for Gerbera cultivation. The best performance of plant samples was obtained from vermiculite culture media, but since there were no significant differences between vermiculite and vermiculite: perlite, so to reduce production costs, the use of vermiculite: perlite culture medium in the closed system is recommended for the cultivation of Gerbera plant.

    Keywords: NFT system, Closed irrigation system, Flower diameter, Integrated planting bed
  • N. Fakhar, A. Sharifi*, A. Chavoshi Khamneh, A. Kasraian Fard, Z. Heydar, S. H. Dashti, A. Jafarian
    Background

    Early oral feeding, as one of the most important components of multimodal strategies referred to as Enhanced Recovery After Surgery (ERAS), is now widely adopted for optimization of postoperative recovery of surgical patients.

    Objective

    To assess ERAS outcome in patients who underwent liver transplantation in our center.

    Methods

    In a prospective study, patients who underwent liver transplantation from April 2015 to June 2018 at Imam Khomeini Hospital Complex, affiliated to Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran, were enrolled in this study. Serum albumin, total iron-binding capacity (TIBC), and course of hospital stay were assessed.

    Results

    39 (23 male) patients who underwent choledochojejunostomy with Roux-en-Y anastomosis for liver transplantation were enrolled. The mean±SD pre-operative serum albumin and TIBC levels of patients were 3.0±0.6 (range: 1.9–4.1) g/dL and 304±75 (range: 154.0–437.0) µg/dL, respectively. The mean±SD time between the end of operation and starting oral feeding was 11.6±1.8 (range: 9.0–15.0) hours. All patients tolerated early oral feeding with liquids followed by solid foods; no vomiting reported in patients. Overall, patient survival rates at one month and three months were 89.7% and 89.7%, respectively. In our study, no leak of anastomosis was reported.

    Conclusion

    There was no major harm for ERAS after liver transplantation and it might be even helpful as in colorectal surgeries. As seen in our study, oral feeding was started as soon as possible after the end of operation in almost all patients and all of them tolerated early oral feeding. No one had vomiting or nausea.

    Keywords: ERAS, Liver transplantation, Roux-en-Y Choledochojejenostomy
  • آرزو شریفی*، حسین شیرانی، علی اصغر بسالت پور، عیسی اسفندیارپور بروجنی

    فرسایش بین شیاری یکی از انواع مهم فرسایش است که سهم عمده ای در انتقال ذرات ریز خاک به ویژه در مناطق خشک و نیمه خشک دارد. به همین منظور هدف از انجام این مطالعه تعیین حساسیت خاک چهار نوع کاربری اراضی مختلف اطراف شهرستان جیرفت به فرسایش بین شیاری هم به وسیله شبیه سازی باران و هم از طریق تعیین تعدادی از شاخص های پایداری خاکدانه بود. کاربری های مورد بررسی شامل مرتع دست خورده، مرتع دست نخورده، جنگل حفاظت شده، و جنگل مصنوعی بود. برای انجام این کار متناسب با میانگین بلندمدت منطقه بارانی با شدت 60  میلی متر بر ساعت توسط دستگاه شبیه ساز باران بر روی خاک ایجاد و فرسایش بین شیاری اندازه گیری شد. سپس شاخص های پایداری خاکدانه و برخی خصوصیات فیزیکی و شیمیایی خاک اندازه گیری شدند. نتایج نشان داد که بیشترین مقدار ماده آلی، رس و مقاومت کششی، و کمترین مقادیر جرم مخصوص ظاهری، درصد شن و بعد فراکتال در مرتع دست نخورده (پوشش غالب درمنه، گون، یال اسبی و گیس پیرزن) وجود داشت. توزیع اندازه ذرات رسوب در مرتع دست نخورده کوچکتر و در جنگل حفاظت شده بزرگتر بود. هم چنین بیشترین غلظت رسوب و بیشترین مقدار فرسایش در مرتع دست خورده وجود داشت. کمترین غلظت رسوب در جنگل مصنوعی و کمترین مقدار فرسایش در جنگل مصنوعی و جنگل حفاظت شده دیده شد. به طور کلی نتایج نشان می دهد که رخداد فرسایش بی شیاری در برخی کاربری ها به ویژگی های ذاتی خاک مانند بافت خاک و در برخی دیگر به شیب زمین بستگی دارد. از طرف دیگر مقایسه مقدار فرسایش و غلظت رسوب نشان می دهد که این دو ویژگی در کاربری های مورد مطالعه با هم مطابقت دارند. به این معنی که می توان غلظت رسوب را به عنوان شاخص مقدار فرسایش در نظر گرفت. در مجموع بهترین روش در جهت کاهش فرسایش بین شیاری در منطقه را می توان انجام اقدامات مدیریتی از قبیل حفظ و احیای پوشش گیاهی دانست که هم ساختمان خاک را بهبود بخشیده و هم فرسایش پذیری آن را کاهش دهد.

    کلید واژگان: شبیه ساز باران، رسوب، مقاومت کششی خاکدانه، رس قابل پراکنش، بعد فراکتال
    A. Sharifi *, H. Shirani, A.A. Besalatpour, I. Esfandiarpour-Boroujeni
    Introduction

     Interrill erosion is one of the major types of erosion playing key role in the transport of fine particles of the soil, particularly in arid and semi-arid regions, which leads to the decrement of soil fertility and surface water pollution. Land-use change is one of the main ways which reflect the interaction of human activities and the natural environment and can impact soil aggregation, aggregate stability, and erodibility. Hence, this research aimed to evaluate the susceptibility of soils under different land-use types (four types) to interrill erosion using both rainfall simulation test and soil aggregate stability indexes. The location of study area was around Jiroft city.

    Materials and Methods

     This study was conducted in four types of land use around Jiroft city in southern Iran, including disturbed pasture, undisturbed pasture, protected forests, and artificial forest. For each land use, 25 points were selected (A total of 100 points for all land uses). To measure soil physical and chemical properties, disturbed and undisturbed soil samples were collected from each point at a depth of 0–20 cm. The samples were transported to the laboratory where these samples were then air-dried. Some soil properties such as texture, organic carbon, electrical conductivity, soil acidity, calcium carbonate equivalent, and bulk density were measured, and available nitrogen, phosphorus, and potassium in the soil and sediment samples were also determined. Furthermore, some characteristics of soil particles, including the geometric mean diameter, geometric standard deviation, particulate organic matter, water-dispersible clay, tensile strength of soil aggregate, mean weight diameter and fractal dimension of aggregates were determined. To assess how susceptible are soils to interrill erosion, rainfall simulator was used to generate rainfall with an average intensity of 60 mm/h.

    Results and Discussion

     According to the results, the undisturbed pasture revealed the highest content of organic matter, particulate organic matter, clay, and tensile strength, while the minimum values of bulk density, sand percentage, and fractal dimension have been observed in this land use. For this reason, it is assumed that the aggregates of undisturbed pasture (intact rangeland) show more stability than other three land uses. The maximum and minimum values of bulk densities were observed in the protected forest (1.58 g cm-3) and undisturbed pasture (1.43 g cm-3), respectively. On the other hand, the highest value of aggregates fractal dimension, as well as minimum values for mean weight diameter and dispersible clay in the protected forest demonstrated that this land use had either no aggregate or its aggregates were very fine. As a matter of fact, lack of organic matter and insufficient clay content can be considered to be the reasons for poor aggregate stability in this land use. The highest and lowest values for tensile strength of soil aggregate were found in the undisturbed rangeland (64.82 kPa) and protected forest (34.38 kPa), respectively. The variations in the tensile strength of soil aggregate can be attributed to the changes in the contents of clay and organic matter in different land uses. Moreover, despite the maximum amount of total organic matter in the undisturbed pasture (or intact rangeland), the amount of sediment organic matter in this land use was lower than the other three land uses. It is because of the fact that most of the OM in this area was of a stable organic matter type, which was under the soil surface and was accordingly protected from surface erosion. The particle size distribution of sediment was smaller in the undisturbed pasture, whereas it was found to be larger in the protected forest. The reason can be attributed to the coarse-textured soil in the forest compared to the finer-textured soil in the undisturbed pasture (or intact rangeland). In addition, the highest sediment concentration and the highest rate of erosion were observed in the disturbed pasture. The artificial forest accounted for the minimum sediment concentration, while the artificial forest, as well as the protected forest, revealed the lowest erosion rate.

    Conclusion

     The results of the current research demonstrated the high rate of interrill erosion in all land uses so that the disturbed pasture and artificial forest accounted for the highest and the lowest rate of erosion (7 and 2 ton/ha) respectively. According the results, intrinsic soil characteristics such as soil texture played major role in some land uses, while for the others, the slope impact was more crucial. On the other hand, both erosion rate and sediment concentration revealed the same trend under four different land uses of the study area. Therefore, because of the fact that the highest and the lowest rate of erosion, as well as sediment concentration, were found to be in the disturbed pasture, and the artificial forest, respectively, therefore the sediment concentration can be considered to be an important index for soil erosion. Due to high rates of erosion occurring in the study areas, some measures have to be undertaken to prevent and control soil erosion in this area. To achieve this aim, preventing people from entering the vulnerable area, avoiding livestock grazing, protecting existing plants and restoration of native plants can be mentioned as efficient measures to improve conditions.

    Keywords: Dispersible clay, Fractal dimension, Rainfall simulator, Sediment, Tensile strength of aggregate
  • محمدنقی ایمانی، سکینه رضایی سیروس، اصغر شریفی
    هدف

    پژوهش حاضر با هدف ارایه مدل بازگشت سرمایه در آموزش و بهسازی منابع انسانی انجام پذیرفت. 

    روش

     روش تحقیق ازنظر هدف کاربردی و از نظر نوع داده آمیخته اکتشافی بود. جامعه آماری در بخش کیفی پژوهش، مدیران و خبرگان شهرداری تهران بودند که به صورت گلوله برفی و هدفمند انتخاب شدند. جامعه آماری در بخش کمی شامل، مدیران شهرداری شهر تهران بود که با استفاده از فرمول کوکران و نمونه گیری تصادفی طبقه ای، تعداد 315 نفر انتخاب شدند. به منظور تعیین روایی پرسشنامه از روایی ظاهری، محتوایی  و سازه  استفاده شد و برای تعیین پایایی،از آلفای کرونباخ و پایایی ترکیبی استفاده شده که همگی مورد تایید قرارگرفتند. برای تحلیل داده های کیفی پژوهش از تحلیل محتوا استفاده شد. در بخش کمی از آزمون های تحلیل عاملی و الگو یابی معادلات ساختاری و آزمون تی تک گروهی استفاده شد. 

    یافته ها

     نتایج نشان داد که مولفه های فرهنگ سازمانی، رهبری، صلاحیت حرفه ای، به عنوان عوامل اثرگذار و رضایت شغلی، بالندگی سازمانی و عملکرد شغلی، به عنوان عوامل اثرپذیر شناسایی شدند. همچنین، مولفه های طرح یا برنامه آموزشی، جمع آوری داده ها، جداسازی تاثیرات برنامه،تبدیل داده به ارزش پولی، فهرست هزینه های برنامه، محاسبه نرخ بازگشت سرمایه، شناسایی مزایای نامحسوس و گزارش نویسی، به عنوان عوامل تشکیل دهنده معرفی شدند. 

    نتیجه گیری

    بنابراین یکی از عوامل مهم در این زمینه، توجه به بازگشت سرمایه  به عنوان الگویی مهم در ارزیابی اثربخشی آموزش و بهسازی کارکنان است.

    کلید واژگان: آموزش، باز گشت سرمایه، بهسازی
    M.Tagheimani, S.Rezaeisirous, A.Sharifi
    Objective

    The purpose of this study was to present a return on investment on training and improvement of human resources.

    Methods

    The research method was applied in terms of purpose and terms of an exploratory sequential mixed one. The statistical population in the qualitative part of the study was managers and experts of Tehran municipality who were selected as a snowball and purposeful sampling. The statistical population in the quantitative section consisted of Tehran municipality’s managers who were selected using Cochran formula and stratified random sampling. To determine the face, content, and construct validity were used and to determine the validity, and to determine reliability, Cronbach's alpha and composite reliability were used, all of which were confirmed. In a small part, factor analysis tests and structural equation modeling and T - group tests were used.

    Results

    The findings showed that the components of organizational culture, leadership, professional competence were identified as effective factors on job satisfaction, organizational development, and job performance. Also, the components of the design or curriculum, data collection, disaggregation of program impacts, monetary data conversion, and program cost list, return on investment rate calculation, intangible benefits identification, and reporting were introduced as constituents.

    Conclusion

    Therefore, one of the most important factors in this regard is the attention to the Return on Investment (ROI) as an important model in evaluating the effectiveness of training and improving human resources.

    Keywords: Education, Return on Investment (ROI), Improvement
  • سمیرا طالبی نجف آبادی، اکرم شریفی*، علی اصغر آبسالان

    برای بهبود ارزش تغذیه ‏ای حبوبات می‏ توان از فرآیند جوانه زنی استفاده نمود. در این مطالعه اثر فرآیند جوانه ‏زنی بر برخی خصوصیات تغذیه‏ ای ماش نظیر میزان رطوبت، پروتئین، چربی، خاکستر، فیبرخام، کربوهیدرات، مواد معدنی و ترکیبات فنلی مورد بررسی قرار گرفت. عملیات جوانه زنی از طریق خیساندن ماش به مدت 24 ساعت و نگهداری در شرایط مرطوب در دو زمان 48 و 72 ساعت و دو دمای 15 و 25 درجه سانتی گراد صورت پذیرفت. سپس جوانه ها در دمای 50 درجه سانتی‏ گراد خشک و آسیاب شدند و خصوصیات تغذیه ای آنها در سه تکرار اندازه‏ گیری و با نمونه شاهد در یک طرح کاملا تصادفی در سطح آماری یک درصد مورد مقایسه قرار گرفتند. نتایج این مطالعه نشان داد که متناسب با رشد جوانه، میزان پروتئین و رطوبت دانه افزایش یافتند. از سوی دیگر جوانه زنی باعث کاهش میزان چربی در ماش شد و با افزایش روند جوانه زنی این مقدار به تدریج کاهش یافت. همچنین فرآیند جوانه زنی، کاهش میزان خاکستر، فسفر و ترکیبات فنلی در ماش را به همراه داشت. جوانه زنی تا زمان 48 ساعت سبب افزایش فیبرخام شد و با افزایش روند جوانه زنی این مقدار کاهش یافت. همچنین میزان کربوهیدرات، آهن، کلسیم و روی نیز بعد از جوانه زنی افزایش یافت. با توجه به نتایج بدست آمده، بهترین شرایط برای بهبود ارزش تغذیه ‏ای ماش از طریق جوانه زنی در دمای 25 درجه سانتی‏ گراد و در زمان 72 ساعت است.

    کلید واژگان: ماش، جوانه زنی، ارزش تغذیه ای، مواد معدنی، ترکیات فنلی
    S. Talebi Najaf Abadi, A. Sharifi *, A. A. Absalan

    Germination process can be used to improve the nutritional value of pulses. In this research, the effect of the germination process on nutritional values of mung bean such as moisture, protein, fat, ash, crude fiber, carbohydrates, minerals, and phenolic compounds were evaluated. Germination process was carried out with soaking mung bean seeds for 24 hours and then incubating them in the wet condition for 48 and 72 hours at 15 °C and 25 °C. The germinated seeds were dried and milled at 50 °C. The nutritional values were measured in samples and compared with control samples using a factorial experiment based on completely randomized design with three replications. The results of this study showed that protein and moisture content of the germinated seeds were increased as germination has proceeded. On the other hand, germination caused a reduction in the fat content of the mung bean. Germination also reduced the amount of ash, phosphorus and phenolic compounds in the mung bean. Germination until 48 hours increased the amount of crude fiber but after this time the amount of crude fiber was reduced. The amount of carbohydrates, iron, calcium, and zinc also increased after germination. According to the results, 72 hours at 25 °C are the best conditions for increasing the nutritional value of germinated seeds in mung bean.

    Keywords: mung bean, germination, nutritional value, Minerals, Phenolic compounds
  • Z Khishvan, S Khoram Rooz, A Sharifi, AM Khosravani*, S.M Tabatabaei
    Background & aim

    Resistance to β-lactam antibiotics in the clinical isolates, in most cases is caused by βlactamase enzymes. In recent years, The incidence of broad-spectrum β-lactamase enzymes (ESBLs) among clinical isolates especially E.coli is greatly increased, since the β-lactamase have several subfamilies, using universal primers designed to detect the following complete families could be useful. β-lactamase producing enzymes (ESBLs) of E. coli has created many problems for patients. β-lactamase CTX-M-1 gene is the cause of resistance. The aim of this study was to evaluate CTX-M-1gene in E.coli.

    Methods

    In this practical study, susceptibility of isolated bacteria to 13 antibiotics were indicated by disk diffusion method according to CLSI guidelines and strains were analyzed for the presence of widespread βlactamase enzymes via two-disc synergy method. Thus، the prevalence of CTX-M1 ESBL gene samples were determined using PCR and the data were analyzed using ANOVA.

    Results

    A total of 200 isolates of E.coli were isolated. The presence of CTX-M-1 gene were also isolated using the PCR method. From 200 strains studied, 62 (31%), of strains produced ESBL. After PCR processing of 62 produced ESBL, 43 isolates (69.4%) were identified as CTX-M-1 genes. Also, antibiotic susceptibility test showed the highest percentage of resistance to Cotrimoxazole antibiotic (50%) and the lowest antibiotic resistance to imipenem (0%).

    Conclusion

    The results of this study showed the high percentage of β-lactamase resistance among of E.coli strains. This is a serious public hazard that should be pointed out to measures for preventing this hazard. Considering the sensitivity of the studied beta-lactam resistant isolates and isolates in Iran to imipenem, a carbapenem with a non-beta-lactam antibiotic is recommended for the treatment of nosocomial infections caused by these strains

    Keywords: E.coli, ESBL, PCR, CTXM1
  • A. Sharifi *
    Background and Objectives
    High resolution multi-spectral (HRMS) images are essential for most of the practical remote sensing applications. Pan-sharpening is an effective mechanism to produce HRMS image by integrating the significant structural details of panchromatic (PAN) image and rich spectral features of multi-spectral (MS) images.
    Methods
    The traditional pan-sharpening methods incur disadvantages like spectral distortion, spatial artifacts and lack of details preservation in the fused image. The pan-sharpening approach proposed in this paper is based on integrating wavelet decomposition and convolutional sparse representation (CSR). The wavelet decomposition is performed on PAN and MS images to obtain low-frequency and high-frequency bands. The low-frequency bands are fused by exploring the CSR based activity level measurement.
    Results
    The HRMS image is restored by implementing the inverse transform on fused bands. The fusion rules are constructed, thus to transfer the crucial details from source images to the fused image effectively.
    Conclusion
    The proposed method produces HRMS images with rational spatial and spectral qualities. The visual outcomes and quantitative measures approve the eminence of the proposed fusion framework.
    Keywords: Remote Sensing, Image fusion, Pansharpening, Discrete wavelet transform, Convolutional Sparse representation
  • فرزاد غریب پور جهان آباد، یاسر محمودی موردراز، پریا زنگنه، اصغر شریفی، محسن نغماچی، سید سجاد خرم روز*، سجاد حسن زاده
    زمینه و هدف

    استافیلوکوکوس اورئوس در سطوح مختلف بدن انسان از جمله پوست و غشای مخاطی به ویژه سوراخ‏های قدامی بینی کلونیزه می شود. در روش کواتایپینگ بر اساس پلی مورفیسم ژن کواگولاز (coa)، استافیلوکوکوس اورئوس تیپ بندی می شود. هدف از این مطالعه تعیین کواتایپ های استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده از سوراخ قدامی بینی در کارکنان بیمارستان های شهید بهشتی و امام سجاد شهر یاسوج بود.

    روش بررسی

    در این مطالعه توصیفی مقطعی، 125 ایزوله استافیلوکوکوس اورئوس از سوراخ قدامی کارکنان بیمارستان های شهید بهشتی و امام سجاد جمع آوری شد. برای تایپینگ ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس ناحیه '3 ژن coa به وسیله واکنش زنجیره ای پلی مراز تکثیر شد. در نهایت محصولات PCR با آنزیم III Hae تحت برش آنزیمی قرار گرفتند و بر روی ژل آگاروز الکتروفورز شدند. سویه های باکتری بر اساس تفاوت در تعداد و اندازه باندهای DNA تیپ بندی شدند. داده های جمع آوری شده با استفاده از آزمون های آماری توصیفی تجزیه و تحلیل شدند.

    یافته ها

     با تکثیر ژن coa، 9 الگوی مختلف تک باندی به اندازه تقریبی 400 تا 860 جفت باز  دیده شد.  در بین باندهای مشاهده شده، باند 610 جفت بازی در 36 (8/28%) ایزوله به عنوان تیپ غالب شناسایی شد. به دنبال برش آنزیمی ژن coa با آنزیمIII Hae ، 15 الگوی متفاوت کواتایپ از شماره C1 تا C15 مشاهده شد. در بین الگوها، الگوی C3 با 24 ایزوله، الگوی غالب بود. الگوی کواتایپ خاصی متعلق به بخش یا گروه شغلی خاصی در هیچ یک از بیمارستان های مورد مطالعه یافت نشد.

     نتیجه گیری

    استافیلوکوکوس اورئوس های جدا شده از بینی کارکنان بیمارستان ها، تنوع ژنتیکی زیادی را در ژن coa خود نشان دادند، اما فقط تعداد کمی از کواتایپ ها به عنوان سویه غالب بودند. از آنجا که کوا تایپ غالبی در هیچ یک از بخش ها و گروه های شغلی یافت نشد، منبع باکتری ها برای کلونیزاسیون در سوراخ های قدامی بینی کارکنان بیمارستان ها احتمالا در محیط خارج از بیمارستان است.

    کلید واژگان: استافیلوکوکوس اورئوس، ناقلین بینی، کواتایپینگ، کارکنان مراکز درمانی
    F Gharibpour Jahanabad, Y Mahmoudi Mourderaz, P Zanganeh, A Sharifi, M Naghmachi, S Hasanzadeh*, SS Khoramrooz
    Background & aim

    Staphylococcus aureus can colonize a variety of body sites such as skin, coetaneous membrane and especially the anterior nares.  The coagulase gene (coa) typing is a technique in which the organism is typed based on the polymorphic region of the coa gene. The aim of the present study was to determine the coa based typing of S. aureus isolates from health care workers in two teaching hospitals in Yasuj city.

    Methods

     In the present cross- sectional study, a total of 125 S. aureus isolates were collected from the nasal nares of healthcare workers in Shahid Beheshti and Imam Sajjad Hospitals in Yasuj city. For typing of S. aureus isolates, amplification of the 3'-end region of the coa gene was performed. Finally, PCR products were digested with HaeIII restriction enzymes and then were electrophoresed on 1.2% agarose gel, and visualized under UV illumination. Bacterial strains were typed according to the DNA bands with diverse size and numbers in each strain. Data were analyzed by descriptive statistics tests.

    Results

     Amplification of the coa gene indicated single band in nine different patterns ranging approximately from 400 to 860 base pair. The coa gene with 610 bp size was seen in 36 isolates and was considered a predominant type. After digestion of PCR products with HaeIII restriction enzymes, totally 15 distinct coa gene RFLP patterns, numbered C1 to C15, were coa observed. The C3 was the most frequent coa type with 24 isolates. There is no specific types belong to wards or professions in each hospitals.

    Conclusion

    S. auras isolated from anterior nares of HCWs showed genetic diversity in their coa gene, but only a few coa gene variants were predominant. Hence no prominent coa type was detected according to the wards or types of profession, the sources of bacteria for colonization in anterior nares of HCWs may be related to the hospital, probably the outside environment.

    Keywords: Staphylococcus aureus, Nasal Carrier, Coa Typing, Health Care Workers
نمایش عناوین بیشتر...
سامانه نویسندگان
  • دکتر اصغر شریفی
    دکتر اصغر شریفی
    استادیار
  • دکتر علیرضا شریفی
    دکتر علیرضا شریفی
    استادیار گروه حقوق، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران
  • دکتر عباسعلی شریفی
    دکتر عباسعلی شریفی

  • اعظم شریفی
    اعظم شریفی
    (1398) دکتری پرستاری، دانشگاه علوم توانبخشی و سلامت اجتماعی
  • آزاده شریفی
    آزاده شریفی
    (1399) دکتری زبان و ادبیات فارسی، دانشگاه تهران
  • علیرضا شریفی گرم دره
    علیرضا شریفی گرم دره
    دانشجوی دکتری مهندسی آب، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران
  • علی شریفی
    علی شریفی

  • افروز شریفی
    افروز شریفی
    استادیار
  • اصغر شریفی
    اصغر شریفی
    استادیار گروه مدیریت آموزشی، دانشکده علوم تربیتی، مشاوره و مدیریت، واحد رودهن، دانشگاه آزاد اسلامی، رودهن، ایران
  • ادیب شریفی
    ادیب شریفی
    دانشجوی کارشناسی ارشد جامعه شناسی، علوم اجتماعی، دانشگاه آزاد اسلامی اسلام آباد غرب، واحد اسلام آباد غرب، دانشگاه آزاد اسلامی، اسلام آبادغرب، ایران
  • آوات شریفی
    آوات شریفی
    (1397) کارشناسی ارشد روانشناسی عمومی، دانشگاه رازی کرمانشاه
  • دکتر علی اکبر شریفی
    دکتر علی اکبر شریفی
    استادیار روانشناسی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران
  • علی شریفی
    علی شریفی
    دانشیار چشم پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی کرمان، کرمان، ایران
  • دکتر علیرضا شریفی
    دکتر علیرضا شریفی

  • دکتر علی اصغر شریفی
    دکتر علی اصغر شریفی
    دانشجوی دکتری حقوق خصوصی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
  • دکتر علی شریفی
    دکتر علی شریفی
    (1402) دکتری علوم قرآن و حدیث، دانشگاه شهید چمران
  • علی شریفی
    علی شریفی
    استادیار استادیار گروه روانشناسی وآموزش کودکان با نیازهای خاص، دانشگاه اصفهان، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران
  • دکتر عباس شریفی
    دکتر عباس شریفی

  • دکتر امیرسینا شریفی
    دکتر امیرسینا شریفی
    (1396) دکترای حرفه‌ای(پزشکی و پیراپزشکی) پزشکی(جراحی عمومی)، دانشگاه علوم پزشکی تهران
  • احمد شریفی
    احمد شریفی

اطلاعات نویسنده(گان) توسط ایشان ثبت و تکمیل شده‌است. برای مشاهده مشخصات و فهرست همه مطالب، صفحه رزومه ایشان را ببینید.
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال