کلونینگ و تجزیه و تحلیل توالی ژن های VP1، VP2 و VP3 در ویروس کم خونی جوجه هندی

ویروس کم خونی جوجه با روش واکنش زنجیره ای پلیمراز در نمونه بافت های جمع آوری شده از گله های طیور در گوجارات، هند مشاهده شد. توالی ژن های VP1، VP2 و VP3 از ویروس CAV آناند (ویروس کم خونی جوجه گوجارات) بعد از کلون کردن محصولات واکنش زنجیره ای پلیمراز در وکتور pDrive به دست آمد. در توالی نوکلئوتیدی این ویروس با توالی دیگر ویروس های CAV، به ترتیب 8/98%-95%، 8/99%-8/98% و 100%-8/98% ناحیه مشابه برای ژن های VP1، VP2 و VP3 نشان داده شد. بررسی توالی اسیدهای آمینه 7/99%-7/91%، 100%-99% و 100%-3/97% شباهت را برای ژن های VP1، VP2 و VP3 نشان داد که نشان دهنده سطح بالایی از حفاظت ژنوم در این ویروس است. علاوه بر این، با قرار دادن نوکلئوتیدها و اسیدهای آمینه در نواحی خاصی از ژنوم ویروس CAV آناند، مشخص گردید که احتمالا این ویروس دارای عوامل بیماری زای بیشتر است. جدایه های CAV در گروه های فیلوژنی هم قرار گرفتند که مستقل از منشاء جغرافیایی ویروس بود.