Detection of Nocardia Asteroides Complex in Clinical Isolates by Real-Time Polymerase Chain Reaction
Message:
Abstract:
Background and Aims

Nocardia asteroides complex is the most common cause of infectious diseases due to nocardiosis. Interspecies differentiation of Nocardia genera is essential for prognosis and timely proper treatment, as well as for epidemiological studies. Since each genus has its own antibiotic resistance, precise careful diagnosis is of prime importance. As compared to biochemical and phenotypic methods, the efficacy of molecular methods for fast and accurate identification of Nocardia species has been proven. The aim of this study was to detect for the first time Nocardia asteroides complex in clinical isolates using real time polymerase chain reaction (Real-Time PCR).

Materials and Methods

Out of the 25 clinical isolates suspected to be Nocardia asteroides genus 10 were identified as Nocardia asteroids complex by biochemical and phenotypic methods, followed by genomic DNA extraction of the suspicious isolates. Nocardia asteroides complex positive controls were prepared using standard strains. Real-time PCR was conducted on all the 10 suspicious isolates. The final real-time PCR samples were sent for sequencing to verify the identified species.

Results

Based on sequencing results 3 of 10 clinical isolates suspected to be identified as Nocardia asteroides complex were confirmed as belonging to the Nocardia asteroids complex genera ─ Nocardia asteroids, Nocardia farcinica, and Nocardia nova.

Conclusion

This study shows that, as compared to biochemical and phenotypic methods, real-time polymerase chain reaction is faster and more specific, and is considered as an efficient method, for Nocardia interspecies identification and differentiation.

Article Type:
Research/Original Article
Language:
Persian
Published:
Scientific Journal of School of Public Health and Institute of Public Health Research, Volume:17 Issue: 3, 2019
Pages:
257 - 268
magiran.com/p2062529  
برخی از خدمات از جمله دانلود متن مقالات تنها به مشترکان مگیران ارایه می‌گردد. شما می‌توانید به یکی از روش‌های زیر مشترک شوید:
اشتراک شخصی
در سایت عضو شوید و هزینه اشتراک یک‌ساله سایت به مبلغ 300,000ريال را پرداخت کنید. همزمان با برقراری دوره اشتراک بسته دانلود 100 مطلب نیز برای شما فعال خواهد شد!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی همه کاربران به متن مطالب خریداری نمایند!
توجه!
  • دسترسی به متن مقالات این پایگاه در قالب ارایه خدمات کتابخانه دیجیتال و با دریافت حق عضویت صورت می‌گیرد و مگیران بهایی برای هر مقاله تعیین نکرده و وجهی بابت آن دریافت نمی‌کند.
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.