بررسی In silico تاثیر لیکوپن بر بیان ژن های مهارگر BRCA1 و BRCA2 در سرطان پروستات

سرطان یک بیماری ژنتیکی است که به دنبال جهش در ژن های کنترل کننده ی فعالیت های سلول بروز می کند، سرطان پروستات یکی از شایع ترین انواع سرطان هایی است که در مردان دیده می شود. برای درمان این بیماری از جراحی، پرتودرمانی، هورمون درمانی و شیمی درمانی استفاده می گردد. این روش های درمانی عوارض متعدد بعد از درمان، ازجمله ناتوانی جنسی به همراه هزینه ی بالای درمان را به همراه دارند. لیکوپن یکی از آنتی اکسیدانت های موثر است که برای جلوگیری از رشد غده های سرطانی کاربرد دارد. پروتیین های BRCA1 و BRCA2 از مهارکننده های تومور هستند. این دو پروتیین با طیف وسیعی از فرآیندهای سلولی مانند ترمیم آسیب DNA، تنظیم رونویسی و بازسازی کروماتین مرتبط هستند. نقص در عملکرد BRCA1 و BRCA2 منجر به نقص در تعمیرات DNA می شود. این بی ثباتی در ژنوم، با انواع سرطان های سینه، تخمدان و پروستات در ارتباط است. در این تحقیق با استفاده از داده های میکروارری حاصل از بیوپسی بیماران مستعد به سرطان پروستات، تاثیر ترکیب لیکوپن بر روی بیان ژن های BRCA1 و BRCA2 موردبررسی قرار گرفته است.

در این پروژه ی پژوهشی که به روش In Silico صورت گرفته، با استفاده از ابزارها و روش های بیوانفورماتیکی، تاثیر لیکوپن بر بیان ژن های BRCA1 و BRCA2 موثر در بروز سرطان پروستات مطالعه گردیده و تغییرات بیان این ژن های مهارگر موردسنجش قرار گرفته است. برای انجام این تحقیق داده های بیان ژن با حجم بالا از پایگاه NCBI بخش GEO دریافت شد، ازآنجاکه این داده های خام به کمک روش میکروارری استخراج و در پایگاه NCBI منتشر شده است، لذا متناسب باهدف این پژوهش، از داده های خام موجود استفاده گردید. برای آنالیز بهینه این داده ها با بهره گیری از نرم افزار Matlab، تغییرات بیان ژن های موردنظر تحت تیمار با ترکیب لیکوپن موردبررسی قرار گرفت. همچنین برای بررسی ارتباطات این ژن ها با همدیگر و دیگر ژن های موثر، از نرم افزار سیتو اسکپ استفاده گردیده است.

مطالعه بیوانفورماتیکی تاثیر لیکوپن بر ژن های BRCA1 و BRCA2 نشان داده است که این ترکیب بر بیان این پروتیین های مهارگر، اثر افزایشی داشته و در اثر تیمار بیماران با این ترکیب مقدار بیان این دو ژن افزایش پیدا کرده است.

 با توجه به آنالیز داده های میکروارری به صورت تثوریک، نتیجه گیری شد که ترکیب لیکوپن ازنظر تاثیر بر دو ژن مهارگر BRCA1 و BRCA2 به عنوان پیشگیری کننده و حتی درمان کننده سرطان پروستات می تواند مورداستفاده قرار گیرد.