مطالعه ویژگی های فنوتیپی، ژنوتیپی و دامنه میزبانی استرین های Pseudomonas savastanoi، عامل گال زیتون و خرزهره

به منظور مطالعه خصوصیات فنوتیپی، مولکولی، بیماری زایی و فیلوژنتیکی عوامل باکتریایی گال های زیتون و خرزهره، نمونه هایی از برگ، دمبرگ، شاخه و تنه این درختان که دارای علایم گره یا گال بودند، از شهرستان‎های مختلف استان‎های مازندران، گیلان، قزوین و تهران جمع آوری و به آزمایشگاه منتقل شد. از محیط کشت Kings’B برای جداسازی استفاده شد و 180 جدایه با رنگدانه سبز فلورسانت خالص‎سازی شد. آزمون بیماری زایی استرین های جداشده از گال زیتون و گال خرزهره نشان داد که این استرین ها روی میزبان اصلی خود بیماری زا بودند. در آزمون های LOPAT، تولید لوان، آنزیم اکسیداز، آنزیم آرژنین دی هیدرولاز و پوسیدگی سیب زمینی، منفی و در آزمون فوق حساسیت در توتون و شمعدانی مثبت بودند. واکنش PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی عوامل گال زیتون (PsvF/PsvR) و خرزهره (PsnF/PsnR) انجام شد و به ترتیب در 18 جدایه از نمونه های گال خرزهره و 14 جدایه از نمونه های گال زیتون باند به اندازه 388 و 349 تکثیر شد. براساس ویژگی های فنوتیپی، بیماری‎زایی و استفاده از آغازگرهای اختصاصی جدایه های زیتون و خرزهره به‎ترتیب، Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi و P. savastanoi pv. nerii شناسایی شدند. به منظور تعیین دقیق جایگاه تاکسونومیکی جدایه ها از روش تجزیه و تحلیل توالی چند مکانی (MLSA) با تکثیر و توالی یابی قطعه‎ ای از سه ژن خانه دار rpoB، rpoD و gyrB استفاده شد. درخت‎های فیلوژنی مبتنی بر توالی ژن‎های gyrB و rpoB نتوانست استرین‎ های Psv و Psn را از هم تفکیک کند، درخت فیلوژنی رسم‎ شده بر اساس ژن rpoD استرین‎های Psv و Psn را از هم تفکیک کرد.