فهرست مطالب
فصلنامه پژوهشهای تولیدات دامی
پیاپی 41 (پاییز 1402)
- تاریخ انتشار: 1402/07/09
- تعداد عناوین: 12
-
-
صفحات 1-12مقدمه و هدف
منع استفاده از گنادوتروپین جفت اسبی (eCG) در همزمانسازی فحلی از طرف کمیته اخلاق حمایت از حقوق حیوانات، باعث توسعه برنامه های جایگزین شده است. یکی از این برنامه های جایگزین استفاده از تیمار کوتاهمدت پروژسترون و تزریق تک دوز هورمون آزاد کننده گنادوتروپین (GnRH) هنگام قطع تیمار پروژسترونی است. نیمه عمر GnRH بسیار کوتاه است و سریعا پس از تزریق توسط پپتیدازها تجزیه و یا توسط گلومرولها دفع می شود. یکی از رهیافت های پیشنهادی طولانی اثر کردن GnRH و حفظ آن در برابر پپتیدازها است. پروپیلن گلیکول و نانو ذرات ژل هیدروکسید آلومینیوم ترکیبات پروتیینی را جذب و سرعت رهش آنها را کاهش میدهند. بنابراین هدف این پژوهش مقایسه اثر تزریق GnRH حلشده در ژل نانوهیدروکسید آلومینیوم و پروپیلن گلیکول بر همزمانسازی چرخه فحلی، القاء تخمکریزی و بازده تولیدمثلی پس از تلقیح مصنوعی در گوسفند نژاد مهربان بود.
مواد و روش هادر فصل تولیدمثلی تعداد 67 راس میش بالغ غیرآبستن (با میانگین وزنی5/33±57/72 کیلوگرم، سن 2-4 سال و نمره بدنی 3/5-3) انتخاب و با اسفنج پروژسترونی برای یک دوره کوتاه مدت 7 روزه تیمار شدند. همه میش ها هنگام برداشت اسفنج 5 میلی گرم PGF2α (دینوپروست) دریافت و سپس به طور تصادفی به چهار تیمار تقسیم شدند. در تیمار 1 هر راس میش در زمان برداشت اسفنج 400 واحد بینالمللی eCG (به صورت عضلانی) نیز دریافت کرد. در تیمار 2 و 3 هر راس میش 36 ساعت پس از برداشت اسفنج به ترتیب 50 میکروگرم GnRH حل شده در ژل نانوهیدروکسید آلومینیوم و یا پروپیلن گلیکول (به صورت زیرجلدی) دریافت کرد. در تیمار 4 هر راس میش 56 ساعت پس از خارجسازی اسفنج 50 میکروگرم GnRH حل شده در آب مقطر (به صورت عضلانی) دریافت کرد. همه میش ها 56 ساعت پس از برداشت اسفنج به روش لاپاراسکوپی تلقیح شدند. در زمان تلقیح، تعداد میش های فحل ثبت و وضعیت فحلی بر اساس تونوسیته رحم درجهبندی شد. غلظت استرادیول (E2) پلاسما 36 و 56 ساعت پس از برداشت اسفنج اندازه گیری شد. غلظت پروژسترون (P4) پلاسما و میزان تخمکریزی نیز 11 روز پس از تلقیح تعیین شد. میزان گیرایی، باروری و زایش گله نیز پس از زایمان محاسبه شد.
یافته هادرصد بروز فحلی، کیفیت فحلی، درصد وقوع تخمک ریزی، تعداد تخمک های آزاد شده بهازای هر میش و غلظت P4 پلاسما بین تیمارها مشابه بود. در تیمار 1 غلظت E2 پلاسما 36 ساعت بعد از برداشت اسفنج بیشتر بود (0/05>p) اما، 56 ساعت بعد از برداشت اسفنج بین تیمارها تفاوتی نداشت. در تیمار3 درصد گیرایی نسبت به میشهای تخمکریزی کرده بهطور معنیداری بیشتر از تیمار 2 بود (0/05>p). درصد گیرایی نسبت به میشهای تلقیح شده، درصد باروری و برهزایی در تیمار 3 بیشتر از سایر تیمارها بود اگرچه این تفاوت از نظر آماری معنیدار نبود.
نتیجه گیری کلی:
آهسته رهش کردن GnRH با حل کردن آن در پروپیلن گلیکول و یا نانوذرات ژل هیدروکسید آلومینیوم مشابه eCG باعث بروز فحلی، تخمک ریزی می شود اما پروپیلن گلیکول کارایی بهتری در همزمانسازی حیوان برای تلقیح مصنوعی دارد
کلیدواژگان: آهسته رهش، باروری، نانوآلوم، هورمون آزادکننده گنادوتروپین، یاور واکسن -
صفحات 13-24مقدمه و هدف
ورمی هوموس یا فضولات کرم خاکی به محصول نهایی تجزیه مواد آلی توسط کرم اشاره دارد که حاوی ترکیباتی شامل مواد هیومیکی (اسید هیومیک، اسید فولویک و هیومین) می باشد. مطالعه حاضر با هدف بررسی اثر مکمل ورمیهوموس بر عملکرد، خصوصیات کمی و کیفی تخم، فراسنجه های بیوشیمیایی سرم و جمعیت میکروبی روده باریک در بلدرچین تخم گذار انجام شد.
مواد و روش هاآزمایش بهمدت هشت هفته با استفاده از 160 قطعه بلدرچین در قالب طرح کاملا تصادفی با هشت تیمار، چهار تکرار و پنج قطعه بلدرچین ماده در هر قفس انجام شد. گروه های آزمایشی شامل سطوح مختلف ورمی هوموس (0، 0/25، 0/50، 0/75، 1، 1/5، 2 درصد) و آنتی بیوتیک ویرجینیامایسین (0/7 درصد) بودند. در طول آزمایش، تمامی تخم های هر قفس روزانه جمع آوری، شمارش، وزن و ثبت شدند. مصرف خوراک در کل دوره آزمایش برای هر قفس به صورت هفتگی محاسبه شد. ضریب تبدیل خوراک مصرفی به تولید تخم از تقسیم خوراک مصرفی روزانه بر میانگین وزن توده تخم روزانه هر بلدرچین محاسبه شد. برخی صفات کیفی تخم شامل ضخامت پوسته، درصد پوسته، استحکام پوسته، درصد زرده، ارتفاع سفیده، واحد IQU و اکسیداسیون زرده تخم اندازه گیری شد. در پایان آزمایش، پنج قطعه پرنده از هر گروه آزمایشی بهطور تصادفی انتخاب و پس از وزنکشی بهروش جابجایی مهره گردن کشتار شدند و یک گرم از محتویات ایلیوم جهت انجام آزمایش جمعیت میکروبی برداشته شد.
یافته هابراساس نتایج، سطوح مختلف ورمی هوموس بر عملکرد بلدرچین های تخم گذار اثر نداشت. اثر مکمل ورمی هوموس بر درصد ضخامت پوسته، درصد پوسته، استحکام پوسته و درصد زرده از لحاظ آماری معنیدار نبود. با افزایش سطح مکمل ورمی هوموس، ارتفاع سفیده و واحد IQU کاهش یافت. سطوح متفاوت مکمل ورمی هوموس تاثیری بر میزان کلسیم، پروتیین تام، کلسترول، گلوکز و آلبومین سرم خون نداشت، نتایج نشان داد که اثر سطوح متفاوت مکمل ورمی هوموس بر جمعیت میکروبی روده باریک بلدرچین تخم گذار معنی دار شد. با افزایش سطح مکمل ورمی هوموس، میزان اکسیداسیون زرده ی تخم بلدرچین تازه و نگهداری شده بهطور خطی و درجه دوم تغییر کرد.
نتیجه گیریبهطور کلی نتایج نشان داد که مصرف ورمی هوموس به عنوان یک ماده غذایی طبیعی، در سطوح 0/5 و 1/5 درصد بهبود عملکرد و افزایش وزن تخم و بهبود خصوصیات کیفی تخم بلدرچین ژاپنی را بههمراه دارد. همچنین، مصرف ورمی هوموس در سطح 0/5 درصد باعث بهبود وضعیت آنتی اکسیدانی زرده تخم و کاهش جمعیت میکروبی غیرمطلوب در روده باریک بلدرچین شده است.
کلیدواژگان: اسید هیومیک، بلدرچین تخم گذار، فراسنجه های بیوشیمیایی خون، ورمی هوموس، ویرجینیامایسین -
صفحات 25-32مقدمه و هدف
آفتابگردان یک محصول روغنی است اما خود گیاه و ضایعات آن بهعنوان علوفه دام استفاده میشود. این پژوهش جهت بررسی جایگزینی ضایعات طبق آفتابگردان با کاه گندم انجام شد.
مواد و روش هااین پژوهش در قالب دو آزمایش صورت گرفت. در آزمایش اول جهت تعیین تجزیهپذیری ماده خشک و الیاف نامحلول در شوینده خنثی از سه راس قوچ نژاد دالاق، دارای فیستولای شکمبهای استفاده شد. در آزمایش دوم تعداد 8 راس برهی نر نژاد افشاری با متوسط وزن زنده 4/5±30 کیلوگرم در قالب طرح چرخشی، با تیمارهای صفر، 7، 14 و 21 درصد در جیره مورد آزمایش قرار گرفتند. دراین پژوهش خوراک مصرفی، قابلیت هضم، فراسنجه های خونی، و فعالیت جویدن اندازهگیری شد.
یافته هانتایج نشان دادکه درصد تجزیه پذیری ماده خشک و الیاف نامحلول در شوینده خنثی در زمان صفر به ترتیب 20/41 و 25/59 درصد و 96 ساعت بعد به بالاترین میزان برابر با 73/47 و 46/40 درصد رسید. در این پژوهش مصرف ماده خشک، تحت تاثیر تیمارهای آزمایشی قرار گرفت (0/003=p). جایگزینی طبق آفتابگردان تا حدودی سبب افزایش قابلیت هضم ماده خشک، ماده آلی و الیاف نامحلول در شوینده خنثی شد ولی معنیدار نبود. تیمارهای حاوی طبق آفتابگردان سبب بهبود ضریب تبدیل خوراک شد ولی تفاوت معنیدار نبود. بره هایی که ضایعات طبق آفتابگردان استفاده کرده بودند نسبت به تیمار شاهد، افزایش وزن بیشتری داشتند. هیچ یک از تیمارهای حاوی ضایعات طبق آفتابگردان، تاثیر معنیداری بر فراسنجه های خونی بره ها نداشتند. فعالیت خوردن، نشخوار و فعالیت کل جویدن تحت تاثیر تیمارهای آزمایشی قرار گرفت (0/01=p). بیشترین فعالیت نشخوار به ازای هر کیلوگرم الیاف نامحلول در شوینده خنثی، مربوط به تیمار شاهد بود.
نتیجه گیریبهطور کلی باتوجه به افزایش وزن روزانه بیشتر تا سطوح 21 درصد در جیره، میتوان ضایعات طبق آفتابگردان را جایگزین کاه گندم نمود.
کلیدواژگان: تجزیه پذیری، ضایعات طبق آفتابگردان، فراسنجه خونی، فعالیت جویدن، قابلیت هضم -
صفحات 33-44مقدمه و هدف
توسعه مداوم فناوری های مولکولی مورد استفاده برای تجزیه و تحلیل رونوشت ها، به ویژه فناوری های توالی یابی نسل بعدی و ابزارهای پیشرفته بیوانفورماتیک، امکان کاوش عمیق تر RNAهای پیام رسان (mRNAs) و RNA های غیرکد کننده (ncRNA) از جمله miRNAها را فراهم می کند. این فناوری ها فرصت های بزرگی را برای اکتشاف عمیق تر دخالت miRNAها در بیماری های حیوانات مزرعه و همچنین بهره وری و رفاه دام ارایه نمودند. از زمان کشف lin-4 و let‐7، هزاران miRNA در گونه های حیوانات مزرعه شناسایی و در پایگاه های داده miRNA ثبت شده اند. miRNAها را میتوان به عنوان نشانگرهای زیستی، اهداف تشخیصی، پیش آگهی و درمانی برای مدیریت بیماری های دام استفاده کرد. با تعیین توالی ژنوم گاو (Bos Taurus)، فرصتی برای کشف miRNAهای جدید در این گونه فراهم خواهد شد. از آنجاییکه تعیین توالی و ساختار miRNA ها به صورت آزمایشگاهی هزینه بر و زمانبر است، بنابراین این پژوهش با هدف استفاده از روشهای محاسباتی مبتنی بر یادگیری ماشین به منظور پیش بینی microRNAها در ژنوم گاو انجام شد.
مواد و روشها:
یافتن روشی دقیق برای شناسایی مولکولهای miRNA میتواند به درک فرآیندهای تنظیمی کمک کند. در حال حاضر روش های محاسباتی مبتنی بر الگوریتم های یادگیری به طور گسترده برای پیش بینی miRNAها استفاده می شوند. با الهام از سایر تحقیقات انجام شده در زمینه شناسایی miRNAها، یک مدل محاسباتی بهبود یافته یادگیری ماشین برای شناسایی توالیهای پیشساز miRNAهای واقعی (pre-miRNA) پیشنهاد شد. در مرحله اول فراوانی توالیهای دو نوکلیوتیدی ژن های pre-miRNA و محتوای بازهای سیتوزین و گوانین (G+C) در توالی ها در نظر گرفته شد. ترکیب دی نوکلیوتیدی مشاهده شده بهعنوان ویژگی های ساختاری ترکیب توالی برای هر ژن miRNA محاسبه شد. مجموع ترکیبات دو نوکلیوتیدی در گونه گاو (Bos Taurus) با محتویات ژنومی G+C برای 1064 توالی miRNA و توالی های غیر miRNA محاسبه شد. در مرحله بعد دو مدل طبقه بندی مبتنی بر رویکرد یادگیری ماشین برای شناسایی pre-miRNA های واقعی و شبه واقعی آموزش داده شدند. مجموعه ای از 17 ویژگی بهینه شده مربوط به ساختارهای توالی برای آموزش مدلها استفاده شد. این مدل ها با روش اعتبارسنجی متقاطع 10 تایی آموزش یافتند و اعتبارسنجی شدند.
یافته هاهدف بررسی عملکرد پیش بینی طبقه بندی کنندهها براساس ویژگی های RNA در تشخیص pre-miRNAها از سایر توالیها بود. مدل آنالیز شده در این پژوهش با استفاده از مجموعه دادههای گاو (Bos Taurus) بهدقت 99 درصد و ضریب همبستگی متیو 97/9 درصد دست یافت.
نتیجه گیری:
روش های محاسباتی هوش مصنوعی می توانند miRNAهای بالقوه جدیدی را در ژنوم گاو شناسایی کنند که برخی از آنها قبلا در این ژنوم شناسایی نشده بودند. در نتیجه لزوم استفاده از روش های محاسباتی جهت شناسایی این RNAهای تنظیمی در دام ها جهت اهداف اصلاحی ضروری به منظر می رسد. نتایج این پروژه نشان داد که تنها با استفاده از ویژگی های ساختاری دو نوکلیوتیدی میتوان در پیشبینی توالی های miRNA به دقت بالایی دست یافت.
کلیدواژگان: بیوانفورماتیک، شناسایی محاسباتی، گاو (Bos Taurus)، یادگیری ماشینی، miRNA -
صفحات 45-58مقدمه و هدف
متخصصین تغذیه دام به دنبال ترکیباتی جایگزین، با توانایی بهبود فرایند تخمیر می باشند. مانند این ترکیبات جایگزین می توان به پروبیوتیک ها و گیاهان دارویی اشاره کرد. از بین گیاهان دارویی که خاصیت ضدمیکروبی هم دارند می توان بومادران و زنجبیل را نام برد. هدف از این پژوهش بررسی اثرات پودر بومادران و زنجبیل بر گوارش پذیری و میزان گاز تولیدی علوفه های اسپرس و یونجه در شرایط برون تنی بود.
مواد و روش هابدینمنظور اندازه گیری گوارش پذیری برون تنی علوفه یونجه، اسپرس و مخلوط 50 درصد یونجه و 50 درصد اسپرس در اثر استفاده از پودر بومادران و زنجبیل به روش تیلی و تری اصلاح شده هلدن انجام گرفت. سطوح مختلف پودر بومادران و زنجبیل در سه سطوح صفر، 1/5 و 3 درصد به سرنگ های 100 میلی لیتری حاوی علوفه های یونجه، اسپرس و مخلوط یونجه و اسپرس اضافه گردید و میزان گاز تولیدی با انکوباسیون سرنگ ها در زمان های 2، 4، 6، 8، 12، 24، 48، 72 و 96 ساعت اندازه گیری و داده های حاصل در قالب طرح کاملا تصادفی تجزیه وتحلیل شدند.
یافته هانتایج نشان دادند که افزودن 3 درصد زنجبیل و پودر بومادران در علوفه اسپرس گوارش پذیری ماده خشک از 55/71 به 68/76 و 74/65 درصد (0/0458=p)، گوارش پذیری ماده آلی در ماده خشک از 52/62 به 64/95 و 62/09 درصد (0/0468=p) و انرژی قابل متابولیسم از 8/42 به 10/39 و 9/93 مگاژول برکیلوگرم ماده خشک (0/0489=p) به روش هلدن را به ترتیب افزایش داد. درحالی که استفاده از زنجبیل و پودر بومادران تاثیر معنی داری بر گوارش پذیری ماده آلی، گوارش پذیری ماده آلی در ماده خشک و انرژی قابل متابولیسم یونجه و مخلوط یونجه- اسپرس ایجاد نکرد. نتایج مربوط به گوارش پذیری به روش مک نیون نشان داد که افزودن 1/5 و 3 درصد پودر بومادران و زنجبیل در علوفه اسپرس و یونجه توانست سبب کاهش میزان گاز تولیدی در زمان های 3، 6، 12، 24، 48، 72، 96 و 120 ساعت انکوباسیون گردد. اما افزودن پودر بومادران و زنجبیل بر مخلوط یونجه- اسپرس تاثیر معنی داری بر میزان گاز تولیدی ایجاد نکرد. نتایج به روش آزمون گاز نشان داد افزودن 1/5 و 3 درصد بومادران و زنجبیل در علوفه اسپرس و یونجه سبب کاهش میزان گوارش پذیری ماده آلی، کل اسیدهای چرب زنجیرکوتاه و انرژی قابل متابولیسم نسبت به گروه شاهد گشت. در این میان 3 درصد زنجبیل بیشترین اثر کاهشی را بر میزان گوارش پذیری ماده آلی از67/80 به 50/14 و 45/99 درصد (0/0092=p)، کل اسید چرب های زنجیرکوتاه از 1/77 به 0/76 و 0/66 میلیمول (0/0183=p) و انرژی قابل متابولیسم از9/88 به 7/47 و 6/79 مگاژول برکیلوگرم ماده خشک (0/167=p) به ترتیب در علوفه اسپرس داشت. همچنین این روند کاهشی مشابه ی در علوفه یونجه برای فراسنجه های تغذیه ای آزمون گاز نیز ادامه داشت. مخلوط یونجه و اسپرس با افزودن سطوح مختلف بومادران و زنجبیل تحت تاثیر قرار نگرفت.
نتیجه گیریبر اساس نتایج حاصل از این پژوهش افزودن سطوح 1/5 و 3 درصد پودر بومادران و زنجبیل در علوفه اسپرس و یونجه نتوانست میزان گاز تولیدی و فراسنجه های حاصل از آزمون گاز را بهبود بخشد.
کلیدواژگان: اسپرس، بومادران، زنجبیل، گاز تولیدی، یونجه -
صفحات 59-69مقدمه و هدف
طی چند دهه اخیر، پس از منع مصرف آنتی بیوتیک های محرک رشد در صنعت طیور تلاش برای یافتن جایگزین های جدیدی همانند پروبیوتیک ها و پریبیوتیک ها افزایش یافته است. برخی از این جایگزین ها می توانند با ایجاد تغییر بهینه در جمعیت میکروبی دستگاه گوارش سبب بهبود رشد و سلامت پرندگان شوند. از اینرو، آزمایش حاضر با هدف بررسی اثر پروبیوتیک پریمالاک و پلیساکارید کاپا-کاراگینان بر عملکرد و سلامت جوجه های گوشتی جوان انجام شد.
مواد و روش ها:
تعداد 240 قطعه جوجه نر یک روزه سویه راس 308 در قالب طرح کاملا تصادفی با آرایش فاکتوریل 2×2 شامل دو سطح افزودنی پروبیوتیک (صفر و 0/1 درصد از جیره) و دو سطح افزودنی کاپا-کاراگینان (صفر و 0/1 درصد از جیره) درون 24 قفس (شش تکرار حاوی 10 پرنده برای هر تکرار) توزیع و بهمدت 24 روز بر روی بستر پرورش یافتند.
یافته ها:
عملکرد رشد پرندگان تحت تاثیر اثر متقابل پروبیوتیک و کاپا-کاراگینان در جیره قرار نگرفت. با اینحال، استفاده از کاپا-کاراگینان در جیره ها توانست در فاصله سنین 1 تا 10 روزگی افزایش وزن بدن پرندگان را به صورت معنی دار افزایش دهد. مصرف خوراک پرندگان نیز تحت تاثیر تیمارهای آزمایشی و سطوح پروبیوتیک و کاپا-کاراگینان قرار نگرفت، اما ضریب تبدیل خوراک با افزودن سطح 0/1 درصد پروبیوتیک در جیره در پایان 24 روزگی بهبود یافت (0/05>P). وزن نسبی ران در پرندگانی که کاپا-کاراگینان دریافت کرده بودند در مقایسه با سطح صفر کاپا-کاراگینان در جیره بیشتر بود (0/05>p). مکمل سازی پروبیوتیک به تنهایی در جیره، سبب افزایش وزن نسبی کبد پرندگان شد. همچنین، پرندگانی که جیره های حاوی کاپا-کاراگینان دریافت کرده بودند، وزن نسبی کبد در آنها بهصورت معنی دار کمتر بود. در جوجه های گوشتی که با کاپا-گاراکینان تغذیه شده بودند، طول پرزها در ناحیه دیودنوم افزایش و عمق کریپت ها در ناحیه ایلیوم کاهش یافت. استفاده از سطح 0/1 درصد پروبیوتیک توانست جمعیت باکتری های اسیدلاکتیکی را در ایلیوم پرندگان به صورت معنی دار افزایش دهد. مصرف جداگانه یا مخلوط کاپا-کاراگینان و پروبیوتیک در جیره، جمعیت کلیفرم ها را در روده کور کاهش داد (0/05>p). استفاده از مخلوط کاپا-کاراگینان و پروبیوتیک در جیره سبب بهبود فعالیت آنزیم سوپراکسید دسموتاز در مقایسه با تیمار حاوی کاپا-کاراگینان شد (05/0>p).
نتیجه گیری:
نتایج آزمایش حاضر نشان داد که استفاده از پروبیوتیک و کاپا-کاراگینان در جیره جوجه های گوشتی جوان میتواند طی دوره های جداگانه ای از پرورش در بهبود برخی از پارامترهای پاسخ رشد و همچنین تغییر بهینه جمعیت میکروبی دستگاه گوارش پرندگان موثر باشد.
کلیدواژگان: جوجه گوشتی، عملکرد رشد، افزودنی خوراکی، مورفولوژی روده -
صفحات 70-79مقدمه و هدف
بررسی معماری ژنتیکی صفات تولیدمثلی بهدلیل اینکه تاثیر عمدهای بر سیستمهای تولیدی در صنعت گوسفنداری دارد، مورد توجه محققین قرار گرفته است. هدف پژوهش حاضر، شناسایی مناطق ژنومی موثر بر تعداد کل نتاج متولد شده و سن اولین برهزایی میشهای نژاد پربازده کایاس با استفاده از آرایه های ژنومی 50K بود.
مواد و روشها:
در این تحقیق، از اطلاعات ژنوتیپی و فنوتیپی 538 راس از میش های با باروری بالا شامل تعداد کل بره متولد شده در طول عمر و سن اولین زایش استفاده شد. آنالیز در سه مرحله شامل تعیین مکان SNPهای معنی دار با ژن، ارتباط ژن ها به طبقات عملکردی و مسیرهای بیوشیمیایی و در ادامه آنالیز همبستگی بین هر یک از مسیرهای عملکردی با صفات فنوتیپی مورد نظر انجام گرفت. ارزیابی پویش ژنومی برای صفات تولید مثلی در نرم افزار GEMMA انجام شد و سپس با استفاده از بسته نرمافزاری biomaRt2 برنامه R ژن های معنی داری که در داخل و یا 15 کیلوباز بالا و پاییندست نشانگرهای معنی دار قرار داشتند، شناسایی شدند. در نهایت، آنالیز غنی سازی مجموعه های ژنی با برنامه برخط KOBAS با هدف شناسایی عملکرد بیولوژیکی ژن های نزدیک به مناطق انتخابی از طریق پایگاه های برخط GO، KEGG، Reactome، BioCyc و PANTHER انجام شد.
یافته هادر این پژوهش تعداد 11 نشانگر تک نوکلیوتیدی روی کروموزوم های 1، 2، 5، 7، 8، 10، 13، 15، 17، 22 و 23 شناسایی شدند. در این مناطق ژن های QULP1،AURKA،TEX12،DLG1T،ACVR1، LCP2 و PPFIA2 که با صفات تولیدمثلی در ارتباط هستند، قرار داشتند. برخی از این ژن های شناسایی شده در این تحقیق با مطالعات قبلی همخوانی داشتند. در تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی، تعداد 19 مسیر بیولوژیکی مرتبط با صفات تولید مثلی شناسایی شدند. برخی از مسیرهای زیستی شناسایی شده در باروری، نرخ تخمکاندازی، بیوسنتز استروژن، نرخ آبستنی، رشد و توسعه عضلات اسکلتی، رشد ابتدایی جنین و سن بلوغ نقش مهمی دارند.
نتیجه گیری:
نتایج حاصل از این تحقیق می تواند نقش مکانیسم های ژنتیکی موثر بر صفات تولید مثلی بیشتر آشکار سازد. با توجه به تایید مناطق قبلی پویش ژنومی و نیز شناسایی مناطق ژنومی جدید در این مطالعه، می توان با اطمینان بیشتراز یافته های این پژوهش در برنامه های اصلاح نژادی برای صفات اقتصادی مهم در گوسفند استفاده نمود.
کلیدواژگان: آنالیز غنی سازی، تک نوکلئوتیدی، چندشکلی تولید مثل، ژن کاندیدا، گوسفند -
صفحات 80-88مقدمه و هدف
ذخیره مناسب علوفه در سیلو سبب حفظ کیفیت بهتر سیلاژ و به حداقل رساندن کاهش ارزش تغذیهای آن در زمان سیلو کردن، ذخیره و در زمان مصرف خواهد شد. نفوذ هوا به داخل سیلاژ یکی از مهم ترین عواملی هست که سبب تحریک رشد باکتریهای هوازی، مخمرها و کپکها میشود. این فرآیند کیفیت سیلاژ را به شدت تحت تاثیر قرار میدهد و باعث فساد هوازی در آن خواهد شد. همچنین این شرایط مقدار ماده خشک و ارزش غذایی سیلاژ را کاهش داده و با افزایش میکروارگانیسمهای بیماری زا و مایکوتوکسینها در سیلاژ در نهایت باعث کاهش مصرف ماده خشک سیلاژ در دام خواهد شد. استفاده از پلی اتیلن به عنوان پوشش و محافظ سیلاژ برای سالهای متمادی مورد توجه و استفاده قرار گرفته است. این پژوهش به منظور ارزیابی مقایسه برخی از شاخصهای شیمیایی و میکروبی سیلاژ علوفه جو تهیه شده توسط کیسه هایی از جنس پلیاتیلن در مقایسه با کیسه های پلاستیکی و در شرایط آزمایشگاهی انجام شد.
مواد و روش هاعلوفه کامل جو با ماده خشک تقریبی 31 درصد برداشت شد و به قطعاتی به طول 30 تا 50 میلی متری خرد شد. سپس 1) در لوله های آزمایشگاهی از جنس پلیاتیلن با درب پیچ دار دارای حلقه های لاستیکی، 2) در کیسه های از جنس پلی اتیلن و 3) در کیسه های پلاستیک هرکدام به وزن تقریبی 10 کیلوگرم در 4 تکرار سیلو شدند و به مدت 60 روز در محیط بسته آزمایشگاه نگهداری شدند.
یافته ها:
نتایج آزمایش نشان داد که در سیلاژهایی که در کیسه های پلیاتیلن ذخیره شده بودند نسبت به سیلاژهایی که در لوله های پلیاتیلن سیلو شدند به ترتیب شاخص اسیدیته (3/79 در مقابل 3/53) و جمعیت مخمرها (0/50 در مقابل 1/14 واحد تشکیل دهنده کلنی در گرم) به طور معنیداری (0/001=p) افزایش داشتند، درحالی که در سیلاژهایی که داخل کیسه های پلاستیکی سیلو شدند، نسبت به سیلاژهایی که در لوله های پلیاتیلن سیلو شدند، تغییرات بیشتری روی داده و به ترتیب مقدار ماده خشک (31/80 درصد در مقابل 31/24 درصد؛ 0/018=p)، الیاف نامحلول در شوینده خنثی (61/89 درصد ماده خشک در مقابل 59/8 درصد ماده خشک؛ 0/014=p) و جمعیت کپک ها (1/95 در مقابل 1/13 واحد تشکیل دهنده کلنی در گرم؛ 0/046=p) نیز به طور معنیدار تغییر پیدا کردند. پایداری هوازی سیلوها در سیلاژهایی که در لوله های پلیاتیلن سیلو شدند بیشترین (95 ساعت) بود درحالی که این شاخص در سیلاژ با پوشش کیسه های پلاستیکی به طور معنی داری (0/001=P) کمتر (62/5 ساعت) از سیلاژهای دیگر بود. بازیابی ماده خشک آن پس از باز کردن سیلوها و پس ازآن به مدت 7 روز پس از هوازدگی نیز به طور معنی داری (0/001=p) نسبت به سایر سیلاژها کمتر (81/50 درصد ماده خشک در مقابل 87/84 درصد ماده خشک و 88/10 درصد ماده خشک) بود.
نتیجه گیریبراساس نتایج به دست آمده در این آزمایش انتخاب کیسه های از جنس پلی اتیلن در مقایسه با کیسه های پلاستیکی برای سیلو کردن بسته های کوچک علوفه میتواند شرایط مطلوب تری برای حفظ کیفیت سیلاژ مهیا کند.
کلیدواژگان: ارزش تغذی های، بسته بندی، سیلاژ جو، کپک، مخمر -
صفحات 89-97مقدمه و هدف
مطالعات اخیر نشان داده اند که مصرف منابع مختلف اسیدهای چرب امگا 3 میتواند در بهبود کیفیت اسپرم در گونه های مختلف نقش مهمی داشته باشد. هدف از اجرای این طرح بررسی اثرات استفاده از منابع مختلف اسید چرب امگا 3 در جیره قوچ قزل، بر حجم و غلظت مایع منی، پروفایل اسیدهای چرب اسپرم، خصوصیات اسپرم تازه و منجمد-یخگشایی شده بود.
مواد و روش هادر این طرح که بهمدت سه ماه اجرا شد، تعداد 16 راس قوچ نربالغ نژاد قزل انتخاب و به صورت تصادفی به 4 گروه تقسیم شده و هر گروه یکی از جیرهها که همه ایزوکالریک و ایزونیتروژنیک بودند شامل: گروه اول: جیره بدون روغن (شاهد)، گروه دوم: جیره با روغن پالم، گروه سوم: جیره با روغن کتان، گروه چهارم: جیره با روغن ماهی، دریافت نمودند. اسپرمگیری پس از عادت دهی قوچها، به صورت هفتگی با مهبل مصنوعی و به مدت 13 هفته انجام شد. پس از ارزیابی ظاهری و اندازه گیری حجم منی، غلظت اسپرم و میزان تحرک در نمونه های منی تازه، نمونه های منی داخل پایوتها منجمد شدند. خصوصیات فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی اسپرمها پس از انجماد-یخگشایی شامل، فراسنجه های جنبایی اسپرم (CASA)، درصد زنده مانی، تست HOST و هانکوک و پروفایل اسیدهای چرب ارزیابی شدند.
یافته ها:
نتایج نشان داد غلظت، زندهمانی اسپرم و یک پارچگی غشاء پلاسمایی اسپرم در گروه های سوم و چهارم نسبت به گروه شاهد و دوم افزایش معنی داری داشتند (0/01>P). همچنین مورفولوژی غیرطبیعی در گروه سوم و چهارم نسبت به دو گروه شاهد و دریافت کننده روغن پالم کاهش معنیداری داشتند (0/01>P). فراسنجه های جنبایی از جمله تحرک کل، سرعت در مسیر مستقیم، سرعت در مسیر منحنی و سرعت در مسیر میانگین در گروه سوم و چهارم نسبت به شاهد و گروه دوم افزایش معنیداری داشتند (0/05>P). همچنین تحرک پیشرونده نیز در گروه چهارم نسبت به دو گروه اول و دوم و گروه سوم نیز نسبت به گروه دوم افزایش معنیداری نشان داد (0/05>P). جیره حاوی روغن پالم باعث افزایش معنی دار پالمیتیک اسید اسپرم در هفته 12 شد (0/05>P). اسیدهای چرب ایکوزاپنتانوییک و دوکوزاهگزاانوییک در گروه های دریافت کننده روغن ماهی و کتان نسبت به گروه دریافت کننده روغن پالم و شاهد (بدون روغن) افزایش معنی داری داشتند (0/01>P). بقیه اسیدهای چرب اندازه گیری شده تغییر معنی داری نشان ندادند.
نتیجه گیری:
نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که افزودن روغن ماهی و کتان به جیره قوچ های نژاد قزل بهمدت 3 ماه باعث بهبود کیفیت خصوصیات فیزیکوشیمیایی و بهبود قابلیت انجماد اسپرم میشود.
کلیدواژگان: اسپرمگیری، امگا3، روغن ماهی، روغن کتان، مایع منی -
صفحات 98-104مقدمه و هدف
توسعه سریع فناوری های توالی یابی کل ژنوم و ابزارهای بیوانفورماتیک، نقطه شروعی برای کشف تنوع ژنتیکی گستره در سطح کل ژنوم موجودات را فراهم می کند. گاومیش از جمله حیوانات اهلی مهم در سطح جهانی است که ارزش اقتصادی زیادی برای جوامع انسانی دارد که برای تولید محصولاتی مثل شیر، گوشت، چرم و نیز به عنوان نیروی کار از آنها استفاده میشود. گاومیش های نژاد خوزستانی یکی از مهمترین نژاد گاومیش در ایران هستند که در غرب و جنوبغربی ایران پراکنده شدهاند. بیشترین جمعیت این نژاد در استان خوزستان وجود دارد که با شرایط جغرافیایی این منطقه کاملا سازگار شدهاند. در این مطالعه، شناسایی تنوع ژنتیکی در سطح کل ژنوم گاومیشهای نژاد خوزستانی با استفاده از تکنیک توالییابی انجام گرفت.
مواد و روشها:
کنترل کیفیت خوانشهای توالییابی شده با استفاده از پارامترهای مرتبط با کیفیت به وسیله ی نرم افزار FastQC (v0.12.1) انجام شد. ارزیابی خوانش های قطعات توالییابی نشان داد که همهی نمونه ها از کیفیت بالایی برخوردار بودند. برای هم ردیفی داده ها با ژنوم مرجع از بسته نرمافزاری BWA-MEM استفاده شد. در ادامه واریانتهای ژنومیک با استفاده از نرم افزار Freebayes به دست آمد. سپس، فیلتراسیون نهایی روی فایل واریانتها انجام گرفت. این فیلتراسیون به منظور افزایش کیفیت آنالیز و حذف واریانتهای با کیفیت پایین انجام گرفت.
یافته ها:
درصد همردیفی برای همهی نمونه ها بالاتر از 97/44 درصد و میزان همپوشانی در نمونه های توالییابی شده بین 4/3x تا 12/9x بود که نشان دهندهی کیفیت مناسب خوانشها است. همچنین، در این مطالعه تعداد 76.676.529 میلیون واریانت شناسایی شده است که به طور نسبتا مساوی در بین کروموزومهای گاومیشهای خوزستانی توزیع شده بودند. بیشترین و کمترین تعداد واریانتها به ترتیب روی کروموزوم شماره 1 و 28 مشاهده شد. در این مطالعه، تعداد جهش های جابه جایی و معکوس شناسایی شده در سطح ژنوم به ترتیب برابر با 298.193.017 و 135.694.466 و نسبت جهش های جابه جایی به معکوس به میزان 2/1989 (Ts/Tv) برآورد شد.
نتیجه گیریوجود تنوع ژنتیکی در جمعیت گاومیش های بومی ایران، پارامترهای باارزشی هستند که با مطالعه آن ها می توان پتانسیل ژنتیکی صفات اقتصادی در این جمعیت ها را به منظور طراحی برنامه های مناسب اصلاح نژادی مورد ارزیابی قرار داد.
کلیدواژگان: توالی یابی کل ژنوم، خوزستانی، گاومیش، واریانت -
صفحات 105-115مقدمه و هدف
نانو ذرات نقره یکی از دستاوردهای جدید در فناوری نانو است که بهعلت فعالیت ضدمیکروبی در زمینه هایی مانند پزشکی، دامپزشکی، کشاورزی و داروسازی کاربرد دارد. نانوذرات نقره می تواند با ماکرومولکول های زیستی وارد واکنش شده و با اختلال هموستاز داخل سلولی سبب القای فرآیند آپوپتوز شود. تنظیم آپوپتوز بسیار پیچیده بوده و پروتیین های مختلف در آن دخیل هستند. پروتیین Bcl2 که شامل پروتیین مهارکننده است از تنظیم کننده اساسی این فرآیند بهشمار می رود و همچنین پروتیین پیشبرنده BAXدر پیشرفت فرآیند آپوپتوزی نقش دارد. لذا این پژوهش با هدف مطالعه اثر زیولیت، اسید ارگانیک و نانو ذرات نقره پوشش داده شده بر زیولیت بر بیان ژن های آپوپتوز BAX و Bcl2 در جوجه های گوشتی انجام شد.
مواد و روش هااین آزمایش با استفاده از 450 قطعه جوجه گوشتی یک روزه سویه کاب 500 در پنج تیمار و شش تکرار با 15 قطعه جوجه در هر تکرار در قالب طرح کاملا تصادفی، انجام شد. تیمارهای آزمایشی شامل: 1) تیمار شاهد (C)، 2) تیمار شاهد مکمل شده با 1 درصد زیولیت (Z)، 3) تیمار شاهد مکمل شده با 1 درصد زیولیت پوشش داده شده با 0/5 درصد نانو نقره (NS)، 4) تیمار شاهد مکمل شده با 0/15 درصد اسید ارگانیک (NOA) و 5) تیمار شاهد مکمل شده با 1 درصد زیولیت پوشش داده شده با 0/5 درصد نانو نقره و 0/15 درصد اسید ارگانیک (NSOA) بودند. جهت بررسی سطوح بیان نسبی ژن های Bcl2 و BAX در روزهای 21 و 42 دوره پرورش نمونه برداری از کبد صورت گرفت.
یافته ها:
نتایج حاصل از این آزمایش نشان داد که بیان ژن Bcl2 در جوجه های گوشتی دریافت کننده تیمار زیولیت در روز 21 دوره پرورش و تیمار نانو ذرات نقره پوشش داده شده بر زیولیت در روز 42 دوره پرورش در مقایسه با میزان بیان این ژن در تیمار شاهد به صورت معنی داری در بافت کبد افزایش یافت (0/05>p). همچنین بیان ژن BAX بافت کبد در تیمار NS و تیمار نانو ذرات نقره پوشش داده شده بر زیولیت مکمل شده با اسید ارگانیک (NSOA) در روز 42 دوره پرورش در مقایسه با تیمار شاهد به طور معنی داری افزایش یافت (0/05>p).
نتیجه گیری:
به طور کلی نتایج این آزمایش نشان می دهد که اثر افزایشی بر بیان ژنهای Bcl2 و BAX توسط تیمارهای زیولیت و NS و NSOA احتمالا میتواند در تنظیم فرایند آپوپتوز در طی شرایط تنشهای اکسایشی نقش داشته باشند. این در حالی است که این اثر در تیمار اسید ارگانیک مشاهده نشد.
کلیدواژگان: آپوپتوز، جوجه های گوشتی، ژن BAX، ژن Bcl2، نانوذرات نقره -
صفحات 116-126مقدمه و هدف
تنش گرمایی یکی از مسایل جدی در صنعت طیور است که باعث خسارات اقتصادی قابلتوجهی میشود. کاهش مصرف خوراک، افزایش دفع و کاهش فراهمی زیستی مواد مغذی در طول تنش گرمایی باعث کاهش عملکرد و قدرت سیستم ایمنی میشود. سلنیوم یک عنصر کمیاب ضروری برای انسان و حیوانات است که در بهبود وضعیت آنتیاکسیدانی و سیستم ایمنی و پاسخ التهابی نقش دارد. هدف از انجام این آزمایش بررسی اثرات منابع مختلف سلنیوم (2 هیدروکسی 4 متیل سلنو بوتانوییک اسید، سلنو متیونین و سلنیت سدیم) بر عملکرد، خصوصیات لاشه، متابولیتهای آنتیاکسیدانی خون، فراسنجه های خونی و پاسخ ایمنی جوجه های گوشتی در شرایط تنش گرمایی بود.
مواد و روشها:
این پژوهش آزمایشی در قالب طرح پایه کاملا تصادفی با استفاده از 240 قطعه جوجه گوشتی نر سویه آربرآکرز انجام شد. جوجه ها در 4 تیمار و 6 تکرار (هر تکرار 10 جوجه) توزیع شدند. تیمارهای آزمایش شامل 1) جیره پایه + 0/3 میلیگرم 2 هیدروکسی 4 متیل سلنو بوتانوییک اسید در هر کیلوگرم جیره غذایی 2) جیره پایه + 0/3 میلیگرم سلنو متیونین در هر کیلوگرم جیره غذایی 3) جیره پایه + 0/3 میلیگرم سلنیت سدیم در هر کیلوگرم جیره غذایی 4) جیره پایه بدون افزودنی (شاهد) بودند. از زمان شروع تنش حرارتی 22 روزگی تا 42 روزگی جوجه ها از 10 صبح تا 16 بعدازظهر تحت محدوده حرارتی 32 تا 34 درجه سانتیگراد قرار گرفتند.
یافته ها:
نتایج نشان داد که مصرف خوراک جوجه ها، میانگین افزایش وزن بدن و ضریب تبدیل خوراک تحت تاثیر تیمارهای آزمایشی قرار نگرفت. استفاده از منابع مختلف سلنیومی بر فاکتورهای بیوشیمیایی خون در جوجه های گوشتی تحت تنش گرمایی تاثیر معنیدار نداشت. اضافه کردن منبع سلنیومی 2 هیدروکسی 4 متیل سلنو بوتانوییک اسید به جیره در مقایسه با تیمارهای دیگر به طور معنی داری مقدار تیتر آنتیبادی ایمونوگلوبولین G را افزایش داد (0/05>p). جیره های حاوی منابع سلنیومی وزن نسبی طحال را در مقایسه با تیمار شاهد به طور معنی داری افزایش دادند (0/05>p). تیمارهای حاوی منابع سلنیومی 2 هیدروکسی 4 متیل سلنو بوتانوییک اسید و سلنو متیونین سبب کاهش معنیدار وزن نسبی کبد شدند (0/05>p). استفاده از منابع سلنیومی در تیمارهای مختلف باعث افزایش معنیدار غلظت آنزیمهای گلوتاتیون پراکسیداز، سوپراکسید دیسموتاز و کاتالاز در خون شد (0/05>p).
نتیجه گیری:
استفاده از منابع سلنیومی سبب بهبود سیستم ایمنی بدن و وضعیت آنتیاکسیدانی خون در جوجه های گوشتی شد.
کلیدواژگان: پاسخ ایمنی، تنش گرمایی، جوجه های گوشتی، عملکرد، 2 هیدروکسی 4 متیل سلنو بوتانوییک اسید
-
Pages 1-12Introduction and Objective
The banning of equine chorionic gonadotropin (eCG) application for estrus synchronization by ethics committee for protection of animal rights, has caused the development of alternative protocols. One of the alternative protocols based on a short-term progesterone treatment and single dose injection of GnRH after termination of progesterone treatment. Half-life of GnRH is very short and it is rapidly degraded by peptidases and cleared by glomerular filtration. One of the suggested approaches is to prolong the action of GnRH and protect it against peptidases. Propyleneglycol and aluminum-hydroxide-gel nanoparticles absorb protein compounds and reduce their release rate. Therefore, the aim of this study was to compare the effect of GnRH dissolved in aluminum-hydroxide-gel nanoparticles or propyleneglycol on estrus synchronization, ovulation induction and fertility outcome after artificial insemination in Mehraban ewes.
Material and MethodsIn the breeding season total of 67 non-pregnant ewes (with weight average of 57.72±5.33 Kg, aged 2-4 years and BCS 3-3.5) were selected and treated by progesterone impregnated sponge for a 7 days period. All of ewes were received 5 mg PGF2α (Dynoprost) with sponge removal and were divided into four treatments, randomly. Each ewe in T1 was received 400 IU eCG (i.m) immediately after removing the sponge. Ewes in T2 and T3 were received 50 µg of GnRH (s.c) dissolved in aluminum-hydroxide-gel and propyleneglycol 36 h after removing the sponge, respectively. Each ewe in T4 was received 50 µg of GnRH (i.m) dissolved in distilled water 56 h after removing the sponge. All of the ewes were inseminated laparoscopically at 56 h after removing the sponge. During insemination, ewes with estrus signs were determined and uterine status were scored by uterine tone. Blood plasma estradiol (E2) concentration was evaluated at 36 and 56 after removing the sponge. Ovulation rate and plasma progesterone (P4) concentration was measured 11 days after insemination. Conception rate, fecundity and prolificacy were calculated after parturition.
ResultsPercentage of estrus, estrus quality, occurrence of ovulation, ovulation rate, and plasma P4 concentration were similar among groups. Plasma E2 concentration in T1 was significantly higher 36 after removing the sponge (P<0.05) but, it was similar among groups at 56 after removing the sponge. Conception rate with regards to ovulated ewes was higher in T3 compared to T2 (P<0.05). Conception rate with regards to inseminated ewes, lambing rate and fecundity were higher in T3 compared to other groups although these differences were not statistically significant.
ConclusionSlowing and extending the release of GnRH by dissolving in propyleneglycol or aluminum-hydroxide-gel nanoparticles induces estrus and ovulation similar to eCG. However, propyleneglycol has better efficiency in synchronizing the animals for artificial insemination.
Keywords: Fertility, Gonadotropin releasing hormone, Nano-alum, Slow-release, Vaccine adjutant -
Pages 13-24Introduction and Objective
Vermi humus refers to the final product of organic material decomposition by earthworms, which contains compounds such as humic substances (humic acids, fulvic acid, and humin). The present study aimed to investigate the effect of vermi_humus supplement on performance, quantitative and qualitative characteristics of eggs, serum biochemical parameters, and microbial population in the small intestine of laying quails.
Materials and methodsThe experiment was conducted for eight weeks using 160 laying quails in a completely randomized design with eight treatments, four replications, and five female quails per cage. The experimental groups consisted of different levels of vermi humus (0, 0.25, 0.50, 0.75, 1.5, and 2%) and virginiamycin antibiotic (7.0%). During the experiment, all eggs in each cage were collected daily, counted, weighed, and recorded. Feed consumption for each cage was calculated on a weekly basis throughout the entire experimental period. The feed conversion ratio was calculated by dividing the daily feed intake by the average daily egg mass of each quail. Some qualitative egg traits were measured, including shell thickness, shell percentage, shell strength, yolk percentage, albumen height, IQU unit, and yolk oxidation. At the end of the experiment, five birds from each treatment group were randomly selected and slaughtered after weighing using the neck bone displacement method, and one gram of ileum contents was taken for microbiological population analysis.
ResultsAccording to the results, different levels of vermi humus did not have any effect on the performance of egg-laying quails. The effect of vermi humus supplement on the percentage of shell thickness, shell percentage, shell strength, and yolk percentage was not statistically significant. By increasing the level of vermi humus supplement, the height of the albumen and IQU unit decreased. Different levels of vermi humus supplements had no effect on the amount of calcium, total protein, cholesterol, glucose, and albumin in blood serum. The results indicated that the effect of different levels of vermi humus supplement on the microbial population of quail's small intestine was significant. With increasing levels of vermi-humus supplement, the degree of oxidation of fresh and stored quail egg yolks changed linearly and in the second degree.
Conclusion :
In general, the results showed that the consumption of vermi humus as a natural food substance improved the performance and egg weight, and enhanced the quality characteristics of Japanese quail eggs at levels of 0.5% and 1.5%. Furthermore, the consumption of vermi humus at a level of 0.5% led to an improvement in the antioxidant status of the yolk and a decrease in the population of undesirable microorganisms in the small intestine of quails.
Keywords: Blood biochemical parameters, Humic acid, Laying quail, Vermi humus, Virginiamycin -
Pages 25-32Introduction and Objectives
Sunflower is primarily an oil crop but the plant itself and its crop residues are used as animal feed. This study was to investigate the replacing of sunflower head wastes with wheat straw.
Material and methodsThis research was conducted in the form of two experiments. In the first experiment, in order to determine the degradability of dry matter and neutral detergent fibre (NDF) of sunflower heads, three rams of Dalagh breed with rumen fistula were used and in the second experiment, 8 male Afshari lambs with an average live weight of 30±4.5 kg were tested in the change-over design with zero, 7, 14 and 21% in the diet. In this research, feed intake, digestibility, blood parameters, and chewing activity were measured.
ResultsThe results showed that degradation percentage of DM and NDF was 20.41 and 25.59, respectively at time zero, and at 96 hour later it reached to the highest level of degradation equal to 73.47% and 46.40%, respectively. In this study dry matter intake (DM) was influenced by the experimental treatments (P=0.003). Replacing wheat straw with sunflower head improved digestibility of dry matter, organic matter and neutral detergent fiber but not significant. The feed conversion rate was improved with sunflower head treatments but not significant. Lambs that were used sunflower head residues, had more weight gain compared to the control group. None of the treatments containing sunflower head residues had a significant effect on blood parameters. Eating and chewing activity and whole chewing activity were influenced by the experimental treatments (p=0.01). The highest rumination activity per kg neutral detergent fiber, was related to the control treatment.
ConclusionIn general, replacing wheat straw with sunflower head residues up to 21 percent in the diet, can be done successfully. In general, according to daily weight gain, sunflower head residues can be replaced up to 21% levels in the diet by wheat straw.
Keywords: Blood parameters, Chewing activity, Degradability, Digestibility, Sunflower head Residues -
Pages 33-44Introduction and Objective
The latest major advances in transcriptomics technologies, especially next-generation sequencing technologies and advanced bioinformatics tools, allows deeper exploration of messenger RNAs (mRNAs) and non-coding RNAs (ncRNAs), including miRNAs. These technologies have offered important chance for a deeper study of miRNA association in farm animal diseases, as well as livestock productivity and welfare. Since the discovery of lin‑4 and let‑7, many microRNAs have been identified in farm animal species and deposited in miRNA databases. miRNA can be used as biomarkers in the context of farm animal disease diagnostics, prediction, and therapeutic purposes, for the management of livestock diseases. By the sequencing of Bos Taurus (cattle) genome, we have an opportunity to discover novel miRNAs in this species. However, the experimental determination of miRNA sequence and structure is both expensive and time-consuming, therefore, computational and machine learning-based approaches have been adopted to predict novel microRNAs in the Bos Taurus (cattle) genome.
Material and methodsFinding an accurate method for Identification of miRNA molecules can help for understanding of regulatory processes. Currently, computational methods based on learning algorithms have been extensively applied for miRNA prediction.Inspired by the work of predecessors, we proposed an improved computational model based on random forest (RF) for identifying real miRNA precursor sequences (pre-miRNAs). First, the occurrence frequencies of the dinucleotide of pre-miRNAs genes, and the percentage of G+C content were calculated. The observed dinucleotide composition was calculated as the structural features of the sequence composition for each miRNA gene. A total of cattle (Bos Taurus) dinucleotide compositions with their genomic G+C contents for 1064 genes encoding miRNA and non-miRNA sequences were calculated. In the next step two classification models based on machine learning approach were trained to identify real and pseudo bovine pre-miRNAs. One set of 17 optimized features related to sequence structures were used to train the models. These models were trained and validated with 10-fold cross validation method.
ResultsOur goal was to investigate the predictive performance of RNA features in distinguishing pre-miRNAs from pseudo hairpins. Our model achieved 99% precision, and 97.9% MCC using Bos Taurus datasets.
ConclusionComputational methods of Artificial intelligence can detect novel potential miRNAs in the bovine genome, some of which to have previously undetected in this genome. As a result, it seems necessary to use computational methods to identify these regulatory RNAs in livestock for breeding purposes. Our discoveries support that dinucleotide features will be beneficial to achieve the highest accuracies for miRNA sequences prediction.
Keywords: Bioinformatic, Cattle (Bos Taurus), Computational identification, Machine learning, miRNA -
Pages 45-58Introduction and Objective
Animal nutritionists are looking for alternative compounds with the ability to improve the fermentation process. Probiotics and medicinal plants can be mentioned among these alternative compounds. Yarrow and ginger can be mentioned among medicinal plants that have antimicrobial properties. The aim of this study was to investigate the effects of yarrow and ginger powder on the digestibility and gas production of sainfoin and alfalfa hay in laboratory conditions.
Material and MethodsFor this purpose, the in vitro digestibility of sainfoin and alfalfa hay and a mixture of 50% alfalfa and 50% sainfoin were measured due to the use of yarrow and ginger powder by Tilley and Terry's modified Holden method. So that different levels of yarrow and ginger powder at three levels of zero, 1.5 and 3% were added to 100 ml syringes containing alfalfa, sainfoin, and a mixture of alfalfa and sainfoin, and the amount of gas produced by incubating the syringes at times 2, 4, 6, 8, 12, 24, 48, 72 and 96 hours of measurement and the resulting data were analyzed in a completely randomized design.
ResultsThe results showed that the addition of 3% of ginger and Yarrow powder in sainfoin hay increased the digestibility of dry matter from 55.71 to 68.76 and 74.65% (P=0.0458), the digestibility of organic matter in dry matter from 52.62 to 64.95 and 62.09 percent (P=0.0468) and metabolizable energy increased from 8.42 to 10.39 and 9.93 MJ kg-1 DM (P=0.0489) by Holden's method, respectively. While the use of ginger and yarrow powder did not have a significant effect on the digestibility of organic matter, the digestibility of organic matter in dry matter and metabolizable energy of alfalfa and alfalfa- sainfoin mixture. The results related to the digestibility according to the McNiven method showed that the addition of 1.5 and 3% of yarrow and ginger powder in sainfoin and alfalfa hay could reduce the amount of gas production at times 3, 6, 12, 24, 48, 72, 96 and 120 hours of incubation. However, the addition of yarrow and ginger powder to alfalfa- sainfoin mixture did not have a significant effect on the amount of gas produced. The results of the gas test method showed that the addition of 1.5% and 3% of yarrow and ginger in sainfoin and alfalfa hay reduced the digestibility of organic matter, total short chain fatty acids and metabolizable energy compared to the control group. Among these, 3% of ginger has the most significant reducing effect on the digestibility of organic matter from 67.80 to 50.14 and 45.99% (P=0.0092), total short chain fatty acids from 1.77 to 0.76 and 0.66 milli moles (p=0.0183) and metabolizable energy from 9.88 to 7.47 and 6.79 MJ kg-1 DM (P=0.0167) respectively in sainfoin hay. Also, this similar decreasing trend continued in alfalfa hay for the nutritional parameters of the gas test. A mixture of alfalfa and sainfoin was not affected by the addition of different levels of yarrow and ginger.
ConclusionIt is concluded that the addition of 1.5 and 3% levels of yarrow and ginger powder in sainfoin and alfalfa hay could not improve the amount of gas production.
Keywords: Alfalfa, Gas Production, Ginger, Sainfoin, Yarrow -
Pages 59-69Introduction and Objective
In recent decades, with the ban on the use of antibiotics in the poultry industry, the use of new alternatives such as probiotics and prebiotics have increased. Some of these alternatives can improve the growth and health of birds by creating optimal changes in the microbial population of the digestive tract. Therefore, the present experiment was conducted to investigate the effect of kappa-carrageenan polysacharid and primalac probiotic on the growth response and health of broilers.
Marerial and Methods240 one-day-old broilers of Ross 308 strain in a completely randomized design with 2× 2 factorial arrangement, including two levels of probiotic additive (zero and 0.1 % of food ration) and two levels of kappa-carrageenan additive (zero and 0.1 % of food ration) distributed in 24 cages (six replicates each containing ten birds) and reared on floor system for 24 days.
ResultsThe growth performance of birds was not affected by the interaction of probiotics and kappa-carrageenan in the diet. However, the use of kappa-carrageenan in diets significantly increased the body weight gain of birds during 1 to 10 days of age. Feed intake of the birds was not affected by the experimental treatments and dietar levels of probiotic and kappa-carrageenan, but the feed conversion ratio was improved by adding 0.1% of probiotic in the diet at day 24 (P< 0.05). The relative weight of thigh in birds that received kappa-carrageenan was higher compared to the zero level of kappa-carrageenan in the diet (P< 0.05). Probiotic supplementation alone in the diet increased the relative weight of the liver of birds. Also, the relative weight of the liver was significantly lower in the birds that received diets containing kappa-carrageenan. In broilers fed with kappa-garakinan, the villus length increased in the duodenum and decreased the crypts depth in the ileum. The use of 0.1% of probiotics significantly increased the population of lactic acid bacteria in the ileum of birds. The population of lactic acid bacteria in the ileum of birds under 0.1% of probiotic increased significantly. Consumption of kappa-carrageenan and probiotics separately or mixed in the diet reduced the population of coliforms in the cecum (P< 0.05). Using a mixture of kappa-carrageenan and probiotic in the diet the activity of superoxide desmutase enzyme improved compared to the treatment containing kappa-carrageenan (P< 0.05).
ConclusionThe results of the present experiment showed that the use of probiotics and kappa-carrageenan in the diet of young broiler chickens can be effective in improving some parameters of the growth response during separate periods of rearing and optimally changing the microbial population of the digestive tract.
Keywords: Broiler chicken, Growth performance, Feed additive, Intestinal morphol -
Pages 70-79Introduction and Objectives
Genetic architecture of sheep reproduction is increasingly gaining scientific interest due to the major impact on sheep production systems. The present study aimed to conduct for identifying the loci associated with total number of progeny born and first lambing age in highly prolific Chios sheep using the 50K arrays.
Material and MethodsIn this research, phenotypic and genotypic data related to total number of lambs born and first lambing age in lifetime and first lambing age were obtained from 538 highly prolific sheep. The gene set analysis consists basically in three different steps: the assignment of SNPs to genes, the assignment of genes to functional categories and finally the association analysis between each functional category and the phenotype of interest. Genome wide association study was performed with reproductive traits using GEMMA software. Using the biomaRt2 R package the SNP were assigned to genes if they were within the genomic sequence of the gene or within a flanking region of 15 kb up- and downstream of the gene. Finally, a gene enrichment analysis was performed with the KOBAS platform from online bioinformatics databases for the assignment of the genes to functional categories, the GO, KEGG, DAVID and PANTHER databases were used.
ResultsIn this research, 11 SNP markers on chromosomes 1, 2, 5, 7, 8, 10, 13, 15, 17, 22 and 23 were identified. Also, we identified different sets of candidate genes related to reproductive traits: QULP1, AURKA, TEX12, DLG1T, ACVR1, LCP2 and PPFIA2 in Chios sheep. Some of these genes identified in this research were consistent with previous studies. In the enrichment analysis of gene sets, 19 biological pathways related to reproduction traits were identified. Some of these pathways have important role in fertilization, ovulation rate, estrogen biosynthesis, conception rate, skeletal muscle development, early development of the fetus and puberty.
ConclusionThe results of this research can further reveal the role of genetic mechanisms affecting reproductive traits. Considering the conformation of previous genomic region and the new genomic regions identified in this study, the findings of this research can be used more confidently in breeding programs for important economic traits in sheep.
Keywords: Candidate gene, Enrichment analysis, Reproduction, Sheep, SNP -
Pages 80-88Introduction and Objective
Efficient forage preservation as silage requires minimizing losses during the ensiling, storage, and feed-out phases. The penetration of air into the silage is one of the important factors that stimulate aerobic bacteria, yeasts, and molds. This process severely impact silage quality and causes aerobic deterioration. Also, these conditions reduce the amount of dry matter and nutritional value of silage, and with the increase of pathogenic microorganisms and mycotoxins in silage, it will ultimately reduce the consumption of dry matter of silage in livestock. Polyethylene has been used for many years as a silage isolate and preservation. This study was to evaluate the chemical composition and microbial population of whole-crop barley silage preserved by different covers in laboratory conditions.
Material and MethodsWhole forage barley with dry matter of approximately 31% was harvested and cut into 30 to 50 mm long pieces. Then they were ensiled 1) in polyethylene laboratory tubes with screw lids with rubber rings, 2) in polyethylene bags and 3) in plastic bags, with an approximate weight of 10 kg in 4 repetitions, and kept in the closed environment of the laboratory for 60 days.
ResultsThe results of the experiment showed the silages that were stored in polyethylene bags, compared to the silages that were ensiled in polyethylene tubes, the acidity index (3.79 vs. 3.53) and the yeast population (0.50 versus against 1.14 cfu/g of silage), were significantly increased (p=0.001), while in the silages that were ensiled in plastic bags, more changes occurred than in the silages that were ensiled in polyethylene tubes, and amount of dry matter (31.80% versus 31.24%; p=0.018), insoluble fibers in neutral detergent (61.89 percent of DM versus 59.8 percent of DM; p=0.014) and the mold population (1.95 versus 1.13 cfu/g of silage; p=0.046) also changed significantly. Aerobic stability in silages ensiled in polyethylene pipes was the highest (95 hours), while this index was significantly (P=0.001) less (62.5 hours) in silage covered with plastic bags than other silages. The recovery of dry matter after opening the ensiles and after 7 days of aerobic exposure also significantly (P=0.001) decreased rather than other silages (81.50 percent of DM versus 87.84 and 88.10 percent of DM).
ConclusionAccording to the results of this experiment, the use of Polyethylene bags rather than plastic bags for ensiling small packages of forage can provide more favorable condition for the preservation of silage quality.
Keywords: Barley silage, Mold, Nutritional value, Packing, Yeast -
Pages 89-97Introduction and Objectives
Recent studies have shown that consuming different sources of omega-3 fatty acids can play an important role in improving sperm quality in different species. The purpose of this study was to investigate the effects of using different sources of omega-3 fatty acids in the diet of Qezel ram, on volume and concentration of semen, fatty acid profile and characteristics of fresh and frozen-thawed sperm.
Materials and methodsIn this study, which was carried out for three months, 16 adult rams of Qezel breed were selected and randomly divided into 4 groups, and each group received one of the diets, all of which were isocaloric and isonitrogenous. The first group: diet without oil (control), the second group: diet with palm oil, the third group: diet with flax oil and the fourth group: diet with fish oil. After habituation of the rams, sperm collection was done weekly with an artificial vagina for 13 weeks. After evaluating the appearance and measuring the sperm volume, sperm concentration and motility in the fresh sperm samples, the sperm samples were frozen packing in straws. Physiological and biochemical characteristics of sperms after freezing-thawing, including sperm motility parameters (CASA), viability percentage, HOST and Hancock test and fatty acid profile were evaluated.
ResultsThe results showed that the concentration, viability and integrity of sperm plasma membrane in the third and fourth groups were significantly increased compared to the control and second groups (P<0.01). Also, the abnormal morphology in the third and fourth groups was significantly reduced compared to the control and palm oil receiving groups (P<0.01). Motility parameters such as total motility, straight line velocity (VSL), curvilinear velocity (VCL) and average path velocity (VAP) in the third and fourth groups showed a significant increase compared to the control and the second group (P<0.05). Also, there was a significant increase in progressive motility in the fourth group compared to the first and second groups, and in the third group compared to the second group (P<0.05). Diet containing palm oil caused a significant increase in sperm palmitic acid in week 12 (P<0.05). Eicosapentaenoic and docosahexaenoic fatty acids increased significantly in the groups receiving fish oil and flax compared to the group receiving palm oil and control (without oil) (P<0.01). The rest of the measured fatty acids did not show any significant changes.
ConclusionThe results showed that adding fish and flax oil to the diet of Qezel rams for 3 months improves the quality of physico-chemical characteristics and improves the freezing ability of sperm.
Keywords: Fish oil, Flax oil, Omega-3, Semen, Sperm collection -
Pages 98-104Introduction and Objective
The rapid development of sequencing technologies and bioinformatic tools has made it possible to sequence the entire genome of many species, providing a starting point for exploring the genome-wide genetic diversity of organisms. The buffalo is one of the most important domesticated animals in the world and has great economic value for humans, being used for milk, meat, leather and most importantly as labor. Khuzestani buffalo are among the most important buffalo in Iran. These animals are scattered in western and southwestern Iran. The largest population of this breed is in the Khuzestan province and they are fully adapted to the geographical features of this region
Material and MethodsIn this study, whole genome sequencing of the Khuzestan buffalo was performed in paired-end format using Illumina technology. Quality control of the readings obtained met all quality parameters and processing of the readings showed that all samples were of high quality. The BWA-MEM software package was then used to match the data to the reference genome. Genome variants were obtained with the Freebayes software. The final filtering of the variant file then took place. This filtering serves to increase the quality of the analysis and to sort out inferior variants.
ResultsThe alignment percentage for all samples was over 97.44% and also the coverage in the sequenced samples ranged from x 4.3 to x 9.12, indicating reasonable quality of the reads. Also, in this study we identified 76,676,529 million variants fairly evenly distributed on the chromosomes of the Khuzestan buffalo. The highest and the lowest number of variants were observed on chromosome 1 chromosome 28, repectively. In this study, the total number of translocation and inversion mutations in the genome level was 298,193,017 and 135,694,466, respectively. In addition, the ratio of transitions to transversion was estimated at 2.1989 (Ts/Tv).
ConclusionThe presence of genetic diversity in the native population of Iranian buffalos are valuable parameters that can be studied to evaluate the genetic potential of economic traits in these populations in order to design suitable breeding programs.
Keywords: Buffalo, Khuzestan, Variant, Whole genome sequencing -
Pages 105-115Introduction and Objective
Silver nanoparticles are one of the new achievements in nanotechnology, which are used in medicine, veterinary medicine, agriculture, and pharmaceuticals due to their antimicrobial activity. Silver nanoparticles can react with biological macromolecules and induce apoptosis by disrupting intracellular homeostasis. Hence, the aim of this study was to the effect of zeolite, organic acid and silver nanoparticles coated on zeolite on the expression of BAX and Bcl2 apoptosis genes in broiler chickens.
Material and MethodsThe number of 450 one-day- old broiler chicks (Cobb 500) were used in five treatments and six repetitions with 15 chicks per replicate in the form of a completely random design. Experimental diets were: control or basal diet (1), a basal diet supplemented by 1% zeolite (2), a basal diet supplemented by 1% zeolite coated with 0.5% nanosilver (3), a basal diet supplemented by 0.15% organic acid (4) and a basal diet supplemented by 1% zeolite coated with 0.5% nanosilver and 0.15% organic (5). The experiment was conducted with broiler chicken from 1 to 42 days old. The expression of the BCL2 and BAX apoptosis genes, liver sampling was done on the 21st and 42nd days of the breeding period.
ResultsThe results of this experiment showed that in broiler chicks receiving zeolite treatment (Z) on d 21 and silver nanoparticles coated on zeolite treatment (NS) on d 42 of the breeding period the expression level of Bcl2 gene in liver tissue was significantly increased (P<0.05) compared to the control treatment (C Also, the expression of the BAX gene in the liver tissue in NS and NSOA treatments on d 42 of the breeding period increased significantly compared to the control treatment (P<0.05).
ConclusionIn conclusion, the results of this experiment showed that zeolite and NS and NSOA treatments have an increasing effect on the expression of Bcl2 and BAX genes, while this effect was not observed in organic acid treatment.
Keywords: Apoptosis, BAX, Bcl2, Broilers, Silver nanoparticles -
Pages 116-126Introduction and Objective
Heat stress is one of the serious issue in poultry industry which causes significant economic losses. Decreasing feed consumption, increasing excretion and decreasing the bioavailability of nutrients during heat stress reduces the performance and immune response. Selenium is an essential trace element for humans and animals that plays a role in improving the antioxidant status and the immune system and inflammatory response. The goal of this study was to investigate the effects of different selenium sources [2-hydroxy-4- methyl seleno butanoic acid, selenomethionine and sodium selenite) on performance, carcass characteristics, antioxidant and immune response and blood characteristics in broiler under heat stress condition.
Material and MethodsThis experiment was conducted in a completely random designs with 240 Arbor Acres (Male) broilers chicks. Chicks were randomly distributed in 4 treatments and 6 replicates (10 chicks in each replicate). The experimental treatments include that: (1) basal diet + 0.3 mg 2-hydroxy-4- methyl seleno butanoic acid; (2) basal diet + 0.3 mg selenomethionine per kilogram of diet; (3) basal diet + 0.3 mg sodium selenite per kilogram of diet; (4) The basal diet that did not have any additives. The birds were kept at 32-340C (10.00 to 16.00; for 6 hours) from 22 to 42 days.
ResultsThe results of this experiment showed that feed intake, body weight gains and feed conservation ratio were not affected by the experimental diets. The use of different sources of selenium had no significant effect on blood biochemical factors in broiler chickens under heat stress. dding selenium source with 0.3 mg/kg 2-hydroxy-4- methyl seleno butanoic acid significantly affected immunoglobulin G in comparison to other treatments. Diets containing selenium sources significantly increased the relative weight of the spleen compared to the control treatment (P < 0.05). The treatments of 2-hydroxy-4- methyl seleno butanoic acid and selenomethionine significantly decreased liver weight percent. The concentration of glutathione peroxidase, superoxide dismutase and catalase enzymes in blood were significantly increased by selenium sources in different treatments.
ConclusionThe use of selenium source improved the immune system and blood antioxidant status in broiler chickens.
Keywords: Immune system, Heat stress, Broilers, Performance, 2-hydroxy-4- methyl seleno butanoic acid